Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  3  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
714248--714282
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0
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0
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0
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2.0
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1.33
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2.8
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12
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31
4
2
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66
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1.19
752748--752786
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17
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1.96
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2.0
23
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2
11
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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20.5
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2.0
24
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1
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25
22
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2.00
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25
26
22
25
2.00
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218
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25
22
25
2.00
840609--840814
80
2.6
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3
247
25
26
22
25
2.00
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20
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27
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1.92
853809--853919
54
2.1
54
89
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36
21
27
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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3
3
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2.1
135
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16
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
914177--914215
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0
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100
0
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0
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32
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2.0
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0
0
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0
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0
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0
2
28
1.02
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3.3
72
85
2
329
14
25
17
42
1.87
980230--980495
46
6.0
46
85
7
343
22
24
15
38
1.92
980409--980484
38
2.0
38
100
0
152
23
26
18
31
1.97
983745--983896
53
2.9
53
91
2
243
21
19
30
28
1.97
988225--988249
12
2.1
12
100
0
50
48
8
0
44
1.32
989251--989292
21
2.0
21
100
0
84
38
0
42
19
1.51
990120--990177
29
2.0
29
86
6
82
53
22
6
17
1.67
993126--993216
30
3.0
30
88
0
128
10
36
8
43
1.71
993186--993821
39
16.2
39
85
4
778
10
35
6
47
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
993567--993820
84
3.1
83
82
11
317
10
37
6
46
1.63
996736--996768
7
4.9
7
96
3
59
15
0
0
84
0.61
1000719--1000747
14
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
1000722--1000767
22
2.0
25
87
12
71
60
0
0
39
0.97
1000738--1000780
14
3.0
14
78
15
52
55
0
0
44
0.99
1000726--1000780
29
1.9
28
85
10
76
58
0
0
41
0.98
1001317--1001356
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
1001611--1001664
27
2.0
27
96
0
99
11
27
18
42
1.84
1003438--1003478
2
20.5
2
89
0
64
48
2
2
46
1.28
1004340--1004365
11
2.4
11
100
0
52
92
0
7
0
0.39
1007065--1008199
395
2.9
390
84
6
1419
37
16
15
30
1.90
1010419--1010466
22
2.1
23
84
3
62
35
2
2
60
1.20
1010425--1010472
23
2.1
23
88
7
71
35
2
0
62
1.07
1023195--1023725
204
2.6
200
83
9
623
32
23
15
29
1.95
1024316--1024352
3
12.3
3
100
0
74
67
0
32
0
0.91
1040280--1040361
29
2.7
29
70
12
76
57
3
8
30
1.46
1041905--1042439
266
2.0
271
84
4
697
34
15
12
37
1.84
1046894--1046948
22
2.7
20
78
13
58
47
0
0
52
1.00
1047275--1047340
27
2.5
25
76
11
69
51
1
0
46
1.10
1047300--1047616
107
3.0
107
94
0
562
44
8
4
42
1.56
1055844--1055906
30
2.1
30
100
0
126
38
3
14
44
1.61
1064734--1064844
54
2.0
55
96
1
206
34
26
1
37
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1076667--1076700
6
5.7
6
92
0
59
32
2
17
47
1.63
1078193--1078218
7
3.7
7
100
0
52
61
0
11
26
1.30
1087176--1087296
61
2.0
62
86
4
174
43
9
16
30
1.79
1093603--1093683
32
2.6
31
75
13
76
22
3
12
61
1.46
1100439--1100474
18
1.9
18
88
5
54
27
2
5
63
1.30
1100438--1100480
19
2.3
19
80
8
52
27
2
4
65
1.25
1104976--1105028
28
1.9
27
84
3
70
43
0
5
50
1.25
1107559--1107626
34
2.0
34
100
0
136
29
5
14
50
1.67
1112785--1112820
17
2.1
18
89
5
56
30
0
2
66
1.06
1117339--1117510
93
1.8
93
94
0
308
27
29
22
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318