Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  270  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85658640--85658690
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24
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0
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0
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2.1
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100
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2.6
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205
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0
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15
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59
62
0
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1.63
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2.7
25
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85700918--85701011
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47
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2.1
13
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1.40
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2.1
27
100
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37
1.62
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10
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33
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75
2.4
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221
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11
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1.90
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35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
85719732--85719902
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
85725457--85725495
17
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4
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1.20
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0
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1.10
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60
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1.10
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20
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0
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21
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0
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0
0
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0
0
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30
0
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2.0
342
98
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1358
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12
18
44
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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5
13
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1.61
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19
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17
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14
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1.76
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14
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14
0
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1.46
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13
2.7
13
90
0
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2
40
1.70
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4.2
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100
0
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16
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13
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20
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5
0
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1.08
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1.71
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2.0
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0
0
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1.00
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17
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0
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13
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2
12
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1.07
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15
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0
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5.4
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12
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14
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14
17
17
1.77
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17
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15
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69
4
18
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1.29
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371
3.2
370
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16
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0
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2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85794508--85794545
19
2.0
19
94
0
67
31
23
10
34
1.89
85805232--85805308
37
2.1
37
100
0
154
24
31
12
31
1.93
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17
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0
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17
28
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1.98
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17
31
22
1.97
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180
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28
18
30
22
1.97
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0
67
31
23
10
34
1.89
85814258--85814625
46
7.9
44
71
15
251
23
28
18
29
1.98
85814265--85814625
94
3.9
95
86
6
481
22
29
18
29
1.98
85818018--85818047
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2.1
14
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0
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0
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3
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2.2
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0
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0
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11
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8
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1.81
85825825--85826001
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18
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1.98
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21
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4
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1.88
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0
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2
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2
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0
0
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1.00
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11
100
0
54
22
18
18
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
22
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1.99
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13
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13
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0
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0
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7
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0
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25
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1.07
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1.95
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2.0
30
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23
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1.30
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0
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1.29
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19
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2
0
48
1.15
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85937257--85937308
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18
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20
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2.2
21
84
3
58
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85937783--85937859
27
2.8
27
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1
1
48
1.17
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49
4.7
49
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3
300
29
27
18
25
1.98
85939341--85939571
100
2.3
98
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2
318
29
27
18
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1.98
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2
183
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19
21
1.92
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2.1
12
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0
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2
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2.3
24
85
11
71
51
1
0
46
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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