Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  245  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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26
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0
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15
15
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1.99
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22
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20
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23
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77221008--77221148
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4.5
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1.83
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16
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30
1.86
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11.3
27
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2.7
27
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2
94
20
24
16
38
1.93
77224546--77224602
19
3.4
19
64
31
56
19
17
15
47
1.83
77224536--77224676
31
4.5
31
90
0
192
20
17
14
47
1.82
77224626--77224703
6
12.8
6
76
12
70
19
19
14
47
1.82
77224536--77224703
18
9.1
18
70
14
101
20
17
14
47
1.82
77228736--77228931
53
3.6
53
79
3
176
38
17
22
20
1.93
77231835--77231945
29
3.8
29
82
1
105
30
16
30
22
1.96
77239918--77240028
29
3.8
29
85
1
114
30
16
31
21
1.95
77242096--77242129
17
1.9
18
88
5
52
38
5
5
50
1.51
77242149--77242387
134
1.8
132
83
8
317
48
6
5
40
1.50
77249790--77249834
22
2.0
22
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53
0
8
37
1.32
77251139--77251192
2
27.0
2
96
0
99
50
48
0
1
1.11
77256343--77256390
21
2.3
21
88
0
69
22
16
27
33
1.96
77257434--77257469
18
2.0
18
100
0
72
50
16
5
27
1.68
77264553--77264760
40
5.2
39
79
4
193
25
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77268971--77269071
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
77272288--77272318
15
2.1
15
100
0
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38
0
41
19
1.51
77276930--77277030
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
77280746--77280953
67
3.2
64
74
10
179
32
16
28
22
1.96
77282038--77282064
2
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2
100
0
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48
0
0
51
1.00
77284196--77284422
48
4.8
48
73
7
178
27
24
21
26
1.99
77292211--77292324
43
2.7
41
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12
115
28
28
20
22
1.98
77292946--77293030
43
2.0
43
100
0
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15
28
1.85
77294202--77294319
31
3.5
35
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9
135
22
23
16
37
1.94
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31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
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24
6.0
24
90
4
200
26
21
22
29
1.99
77294511--77294652
47
3.0
48
88
5
198
26
21
22
28
1.99
77294704--77294763
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
77294806--77294855
25
2.0
25
88
0
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1.9
37
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0
135
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16
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1.96
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27
12.9
27
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371
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21
29
1.81
77296468--77296701
27
8.7
26
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3
236
30
8
21
40
1.82
77296426--77296688
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3.3
81
81
5
212
33
8
20
37
1.84
77296551--77296718
27
6.3
26
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2
174
31
7
19
41
1.78
77301816--77302065
40
6.3
41
89
3
318
23
23
27
26
2.00
77307714--77307759
15
3.1
15
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20
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28
19
8
43
1.80
77313499--77313726
40
5.7
40
87
1
278
25
21
25
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77313499--77313726
120
1.9
121
84
4
309
25
21
25
27
1.99
77321575--77321802
40
5.7
40
90
1
305
24
21
26
27
1.99
77321575--77321802
120
1.9
121
87
4
336
24
21
26
27
1.99
77321573--77321835
120
2.2
121
83
6
331
25
20
25
27
1.99
77325897--77325938
20
2.1
20
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0
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4
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1.51
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13
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0
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24
24
2.00
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0.94
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0
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22
18
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1.97
77343215--77343317
29
3.6
29
87
0
143
26
15
33
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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