Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  292  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
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210
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210
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Indices
Period
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Indels
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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29
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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22
3
0
74
0.96
92072858--92072939
6
13.0
6
72
22
53
21
4
0
73
1.02
92073016--92073139
12
9.8
12
70
23
62
16
4
2
77
1.03
92073041--92073113
10
6.9
10
77
14
51
13
4
2
79
0.99
92077697--92077750
5
10.8
5
100
0
108
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0
0
18
0.69
92084495--92084551
26
2.2
26
100
0
114
26
19
7
47
1.74
92085890--92085947
23
2.4
24
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8
73
18
15
39
25
1.91
92086132--92086174
20
2.1
20
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59
13
2
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1.54
92086407--92086470
22
3.1
22
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48
1.32
92086397--92086480
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39
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150
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4
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46
1.37
92098020--92098068
20
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10
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20
2
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2
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2
92
0
51
46
0
0
53
1.00
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14
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0
73
21
39
0
39
1.54
92117362--92117444
45
1.9
42
80
7
94
7
27
6
59
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
14
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0
58
58
0
20
20
1.39
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3
15.3
3
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4
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31
0
0
68
0.90
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14
3.0
14
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0
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26
9
4
59
1.48
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7
5.6
7
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9
51
86
0
13
0
0.57
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2.1
77
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3
202
27
14
19
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1.92
92142402--92142436
14
2.5
14
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25
14
5
54
1.62
92142343--92142643
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3.5
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10
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28
16
18
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1.93
92144530--92144605
3
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0
152
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0
0
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0.91
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14
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0
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9
4
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1.48
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1.9
18
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0
2
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1.10
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0
0
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2.1
19
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25
7
7
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1.52
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17
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0
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1.15
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0
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0
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127
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24
1.91
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2.2
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25
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176
2.7
176
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0
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29
23
19
27
1.98
92165040--92165136
45
2.2
44
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7
124
26
23
19
29
1.98
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35
4.6
35
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201
33
24
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2.4
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226
33
23
11
31
1.90
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35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
92185886--92186057
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92188099--92188129
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1.9
16
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0
53
0
58
0
41
0.98
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1.9
18
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20
5
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1.43
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21
1.9
21
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10
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10
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35
1.65
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3
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3
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5
0
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1.17
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1
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30
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14
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0
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0
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18
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23
2.1
23
96
0
87
18
58
14
8
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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