Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  288  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
35
100
0
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20
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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0
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13
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.25
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1
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1.33
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29
1.44
91065702--91065777
19
3.9
19
74
6
64
64
3
2
28
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91068963--91069018
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2.1
26
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85
62
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14
10
1.55
91073669--91073748
21
3.8
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81
5
90
46
12
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12
1.78
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10
1.64
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32
2.0
32
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0
119
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10
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37
1.65
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25
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1.78
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5.2
26
90
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209
33
5
24
36
1.78
91095862--91095994
51
2.6
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5
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36
1.78
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1.56
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3
15.7
3
100
0
94
68
31
0
0
0.90
91099341--91099378
5
7.4
5
96
3
67
60
0
0
39
0.97
91099777--91099841
5
13.0
5
77
6
69
53
3
1
41
1.25
91102764--91102813
16
3.2
16
75
18
52
52
0
2
46
1.12
91102794--91102831
18
2.1
19
85
14
53
44
0
0
55
0.99
91102827--91102860
15
2.1
16
89
10
52
58
0
0
41
0.98
91103382--91103411
15
2.0
15
100
0
60
26
13
6
53
1.64
91107774--91107807
17
1.9
18
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5
52
38
2
0
58
1.13
91113223--91113267
23
1.9
24
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4
74
15
4
2
77
1.02
91113360--91113393
11
3.0
11
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32
0
0
67
0.91
91113348--91113445
36
3.0
35
85
14
138
40
0
0
59
0.98
91113336--91113465
22
5.8
22
72
14
79
42
0
0
57
0.98
91113559--91113587
13
2.3
13
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5
51
58
0
0
41
0.98
91113735--91113872
36
4.0
34
83
6
147
55
3
1
39
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91113804--91113849
21
2.1
21
84
11
58
56
2
0
41
1.11
91113826--91113861
13
2.8
14
88
12
51
58
0
0
41
0.98
91113914--91113969
14
4.2
13
83
4
58
75
5
1
17
1.09
91113932--91114035
13
8.2
12
75
16
54
77
3
4
13
1.06
91113961--91114002
18
2.3
18
84
15
52
76
2
2
19
1.01
91113932--91113994
9
7.4
8
77
8
54
77
4
1
15
1.01
91113932--91114036
32
3.4
29
76
16
79
78
3
4
13
1.05
91113993--91114027
18
1.9
18
94
0
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80
2
8
8
1.01
91115063--91115122
22
2.7
22
76
2
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73
5
5
16
1.19
91123702--91123762
31
2.0
31
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6
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44
8
8
39
1.64
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28
2.0
28
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0
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50
26
5
17
1.67
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2.1
17
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0
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0
0
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
0
50
1.00
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2.1
135
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2
473
32
25
17
25
1.97
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50
2.1
52
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3
202
37
25
4
33
1.76
91137013--91137120
26
4.2
26
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4
184
37
25
4
33
1.76
91140784--91141066
133
2.1
136
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2
500
32
25
18
24
1.97
91142848--91142954
25
4.2
25
93
4
180
37
24
4
33
1.76
91145939--91145985
22
2.1
22
100
0
94
40
38
8
12
1.74
91146682--91146968
136
2.1
137
93
0
486
32
24
17
25
1.97
91148754--91148863
26
4.2
26
92
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91148754--91148863
52
2.1
52
100
0
220
36
24
5
33
1.79
91150693--91151021
130
2.5
128
87
3
464
27
17
19
34
1.95
91152875--91152954
41
1.9
42
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110
21
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27
20
1.98
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47
2.4
47
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154
25
16
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35
1.95
91160335--91160373
20
2.1
18
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9
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35
2
0
61
1.10
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0
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0
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0
0
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1.76
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0
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1.69
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17.0
3
100
0
102
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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