Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  87  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26175875--26176216
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12.6
28
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4
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30
1.81
26176198--26176272
27
2.8
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36
20
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34
1.84
26176257--26176524
27
9.6
27
84
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295
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20
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1.95
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2.2
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0
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20
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0
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20
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100
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2
20
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20
0.88
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2.0
34
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112
3.4
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1.90
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74
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4.5
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23
28
24
2.00
26199735--26199910
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79
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264
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23
28
24
2.00
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5.2
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2
305
25
24
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1.99
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5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
26219353--26219504
40
3.8
40
93
0
259
22
22
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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12.3
27
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0
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22
80
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78
20
23
23
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1.97
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5
134
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19
18
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3.2
31
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0
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19
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21
22
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1.99
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3.6
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170
21
22
29
26
1.99
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40
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170
21
22
29
26
1.99
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10
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11
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2
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93
2
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13
2.6
13
100
0
68
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14
14
47
1.82
26262499--26262532
7
5.1
7
86
13
54
23
14
14
47
1.82
26265021--26265193
46
3.7
46
77
13
192
22
20
27
29
1.99
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93
1.8
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93
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21
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28
1.99
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2.0
20
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0
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14
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30
2
16
50
1.58
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18
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1.98
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3.7
43
70
10
110
26
20
24
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
1.21
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17
23
20
1.94
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0
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19
12
19
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17
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10
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2
0
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100
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56
12
8
24
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26333876--26333934
24
2.4
27
73
26
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38
3
1
55
1.26
26336331--26336551
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96
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23
19
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1.98
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25
25
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0
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0
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1.00
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20
2.8
20
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7
80
12
1
5
80
0.95
26340487--26340554
6
10.5
6
77
14
64
11
4
4
79
1.02
26344982--26345233
67
3.9
64
76
9
208
29
17
28
24
1.97
26346280--26346317
2
19.0
2
88
0
58
47
2
2
47
1.30
26351295--26351501
24
8.6
24
97
0
351
20
17
25
36
1.94
26358571--26358605
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
26359049--26359254
24
8.6
24
96
0
324
20
18
25
35
1.95
26380956--26381018
24
2.6
24
100
0
126
34
26
17
20
1.95
26394473--26394541
31
2.2
31
84
2
84
46
1
27
24
1.61
26407448--26407504
22
2.6
22
74
0
60
49
3
3
43
1.36
26407642--26407672
16
1.9
16
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0
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38
0
6
54
1.26
26412890--26412952
30
2.1
30
96
0
117
22
17
26
33
1.96
26412900--26412964
30
2.2
30
86
5
87
21
18
24
35
1.96
26413138--26413251
19
5.9
19
88
10
178
35
10
16
36
1.83
26413138--26413251
37
3.0
37
92
5
183
35
10
16
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26417270--26417414
40
3.6
39
81
6
155
26
23
25
24
2.00
26420701--26420734
17
2.0
17
88
0
50
64
0
35
0
0.94
26423229--26423287
7
8.6
7
80
15
70
84
0
15
0
0.62
26423229--26423279
19
2.5
20
87
6
77
84
0
15
0
0.63
26423229--26423287
28
2.2
26
85
8
82
84
0
15
0
0.62
26424213--26424441
44
5.2
44
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2
264
30
15
26
27
1.96
26424389--26424752
87
4.2
87
91
0
577
27
15
25
31
1.96
26424301--26424741
174
2.5
171
84
6
471
28
15
25
30
1.96
26424780--26425151
78
4.8
77
86
4
505
33
18
22
25
1.96
26424780--26425151
156
2.4
156
92
0
618
33
18
22
25
1.96
26425175--26425293
45
2.7
44
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1
157
31
11
26
29
1.92
26425180--26425305
44
2.8
45
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1
164
31
11
27
28
1.92
26425673--26425805
19
6.9
19
88
8
198
36
9
17
36
1.83
26425673--26425812
37
3.7
38
86
8
198
36
9
17
36
1.82
26425673--26425813
56
2.5
57
87
6
216
36
9
17
36
1.82
26425673--26425828
19
7.8
22
83
12
107
35
8
17
37
1.81
26427604--26427632
12
2.4
12
100
0
58
62
13
0
24
1.32
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17
2.1
17
89
0
54
8
22
0
69
1.15
26434261--26434435
47
3.8
46
78
12
162
22
30
20
26
1.98
26434261--26434455
46
4.2
45
75
16
132
22
30
20
26
1.98
26443899--26444172
47
5.9
45
75
10
219
24
30
19
25
1.98
26443898--26444166
94
2.9
92
80
9
253
23
29
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26447392--26447647
40
6.5
40
88
3
351
22
23
28
25
1.99
26447392--26447647
79
3.2
79
88
2
354
22
23
28
25
1.99
26447392--26447621
119
1.9
118
90
5
365
21
23
29
25
1.99
26455516--26455758
40
6.1
40
91
2
366
21
23
29
25
1.99
26459391--26459557
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
26467431--26467558
40
3.2
39
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5
150
24
22
28
25
2.00
26480167--26480212
23
2.0
23
83
8
58
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1.72
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10.7
3
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32
0
0
67
0.91
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2.4
42
83
1
134
23
15
30
31
1.95
26486976--26487089
43
2.7
43
81
1
140
23
17
28
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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