Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  95  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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2.1
23
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0
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0
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1.9
21
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2.0
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28
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1.98
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3.7
39
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20
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22
1.99
28824161--28824342
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2.3
79
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2
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24
22
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
234
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22
1.99
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24
22
29
23
1.99
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3.7
39
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234
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20
30
22
1.99
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2.3
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23
1.99
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29
1.87
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1.98
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17
27
1.97
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1.97
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1.98
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1.98
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27
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1.99
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22
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0
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0
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19
2.1
19
95
0
71
42
10
10
37
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28897822--28897887
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2.0
33
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0
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28
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19
25
1.99
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12.5
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100
0
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0
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23
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22
29
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1.99
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39
90
2
234
26
20
30
22
1.99
28940133--28940314
77
2.3
79
89
2
269
24
22
29
23
1.99
28948157--28948299
39
3.7
39
90
2
234
26
20
30
22
1.99
28948158--28948339
77
2.3
79
89
2
269
24
22
29
23
1.99
28953464--28953644
40
4.6
40
89
2
258
27
28
18
24
1.98
28955381--28955495
46
2.4
48
85
5
146
22
27
20
29
1.98
28959925--28959955
12
2.5
12
94
5
53
16
3
6
74
1.16
28975184--28975219
14
2.7
13
91
4
54
0
22
0
77
0.76
28975341--28975386
2
23.5
2
82
12
60
43
4
0
52
1.21
28981090--28981275
40
4.7
40
87
5
227
25
27
22
24
2.00
28981983--28982014
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
28998767--28998836
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
28998767--28998848
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
29012836--29012876
21
2.0
21
85
0
55
39
14
29
17
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29014762--29014803
6
6.8
6
91
2
66
64
0
19
16
1.30
29015460--29015484
13
1.9
13
100
0
50
48
8
8
36
1.62
29016619--29016667
25
2.0
25
87
0
71
34
6
16
42
1.73
29016766--29016803
20
1.9
20
88
0
58
18
13
31
36
1.89
29026943--29027126
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
29026983--29027171
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
29029595--29029660
30
2.2
30
97
0
123
22
33
25
18
1.97
29030582--29030635
22
2.4
23
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6
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37
18
22
22
1.95
29044847--29044871
13
1.9
13
100
0
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16
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28
16
1.89
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3.6
53
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6
207
21
25
18
34
1.96
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134
2.0
134
97
0
497
35
24
14
25
1.94
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16
1.9
16
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0
53
35
22
0
41
1.54
29055762--29055801
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
29055987--29056241
55
4.8
54
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7
265
21
25
17
35
1.95
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108
1.8
110
89
4
318
22
25
17
34
1.96
29061439--29061508
22
3.1
22
70
27
58
37
15
20
27
1.93
29061440--29061552
23
4.8
23
79
9
95
36
14
23
26
1.93
29061448--29061518
22
3.2
21
84
11
88
36
12
21
29
1.90
29061448--29061541
45
2.1
45
82
4
109
36
14
22
26
1.93
29068607--29068773
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
29068607--29068773
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
29069599--29069644
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29076612--29076778
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
29076612--29076778
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
29077603--29077648
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
29079679--29079831
71
2.3
70
81
10
178
22
28
16
32
1.96
29087201--29087400
71
2.8
71
98
0
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20
27
17
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1.95
29087200--29087434
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70
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2
350
21
28
17
33
1.95
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2.6
34
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25
25
22
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2.1
37
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0
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1.97
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2.5
49
95
0
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29
33
10
26
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29102181--29102242
25
2.5
24
80
10
72
74
1
17
6
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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