Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  10  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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10
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6
26
31
1.83
2747855--2747960
37
2.9
37
97
0
194
24
19
32
23
1.98
2752177--2752270
24
3.9
24
81
10
120
23
12
28
35
1.92
2752176--2752267
48
1.9
48
88
4
141
21
13
30
34
1.91
2752174--2752328
73
2.1
72
80
8
172
23
12
29
34
1.92
2763151--2763325
77
2.3
77
87
3
246
26
16
20
36
1.93
2763231--2763414
91
2.0
91
87
0
260
26
17
17
38
1.92
2763336--2763529
75
2.6
74
84
4
237
30
18
21
29
1.97
2765363--2765564
3
67.0
3
72
19
122
31
2
3
62
1.25
2765254--2765549
131
2.2
134
86
7
406
30
3
5
61
1.33
2765468--2765548
32
2.5
33
73
17
78
28
3
1
66
1.16
2765725--2765764
10
4.1
10
83
3
55
37
0
10
52
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2765384--2765852
150
3.2
146
78
12
439
31
3
5
59
1.38
2765714--2765769
16
3.6
16
76
7
53
33
0
7
58
1.25
2767205--2767268
3
21.3
3
82
9
69
28
1
4
65
1.21
2767391--2767444
3
18.0
3
96
0
99
35
0
0
64
0.94
2769425--2769455
3
10.3
3
92
0
53
38
0
29
32
1.57
2777164--2777673
132
3.9
131
74
7
397
27
18
18
35
1.94
2778698--2778732
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
2778674--2780103
86
16.5
86
84
7
1855
27
17
18
36
1.93
2779312--2779344
14
2.3
15
90
10
52
12
21
6
60
1.53
2778674--2780099
264
5.5
263
89
5
2063
27
17
18
36
1.93
2779576--2779608
14
2.3
15
90
10
52
12
21
6
60
1.53
2779652--2779893
78
3.0
74
79
15
259
28
16
17
37
1.92
2779564--2780056
164
3.0
164
83
7
608
28
18
18
35
1.94
2779830--2779862
14
2.3
15
90
10
52
12
21
6
60
1.53
2779726--2779937
89
2.4
87
88
4
298
25
18
18
37
1.94
2779843--2780004
75
2.1
75
96
1
297
29
18
19
32
1.95
2779415--2780099
254
2.7
252
81
12
891
27
17
18
36
1.93
2779919--2780149
88
2.6
88
79
7
238
27
16
19
36
1.93
2781226--2781278
25
2.2
25
82
3
63
5
15
3
75
1.13
2781912--2781958
22
2.1
22
88
0
67
38
4
4
53
1.40
2782325--2782390
20
3.4
20
69
19
50
31
7
3
57
1.42
2782461--2782515
27
2.1
25
83
12
67
29
3
5
61
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2788914--2789118
40
5.1
40
84
4
236
27
27
20
24
1.99
2798434--2798811
86
4.3
87
83
7
492
28
16
18
37
1.92
2798677--2798957
146
1.9
143
88
3
420
25
18
16
39
1.91
2798812--2800623
90
20.4
88
86
5
2365
27
17
18
36
1.93
2799098--2799128
14
2.3
13
94
5
53
12
16
6
64
1.47
2798812--2800623
264
6.8
263
90
3
2520
27
17
18
36
1.93
2799807--2799840
14
2.3
15
90
5
52
11
20
5
61
1.50
2798812--2800555
710
2.5
706
91
3
2822
27
17
18
36
1.93
2800072--2800104
14
2.3
15
90
10
52
12
21
6
60
1.53
2800265--2800624
89
4.1
87
86
3
416
26
18
18
36
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318