Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
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Score
A
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51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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87861313--87861398
33
2.6
33
88
0
136
8
50
15
26
1.72
87861560--87861609
20
2.4
21
96
3
93
32
4
6
58
1.41
87864491--87864525
14
2.5
14
85
0
52
40
11
5
42
1.65
87865636--87865708
32
2.4
30
79
4
74
34
1
6
57
1.34
87866118--87866149
16
1.9
17
93
6
57
78
12
9
0
0.97
87866119--87866157
21
1.9
20
85
15
53
76
10
12
0
1.01
87866270--87866328
13
4.3
14
79
12
59
67
0
0
32
0.91
87868962--87869031
29
2.4
28
75
11
70
32
1
5
60
1.29
87870153--87870191
17
2.4
16
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16
53
61
0
7
30
1.24
87878003--87878035
16
1.9
18
88
11
52
48
12
15
24
1.78
87878565--87878736
45
3.9
45
87
3
226
27
28
19
24
1.99
87882280--87882307
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
87882769--87883024
39
6.6
39
87
1
345
22
22
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87889166--87889198
16
1.9
18
88
11
52
48
12
15
24
1.78
87889724--87889854
45
3.0
45
85
6
164
25
29
21
24
1.99
87892491--87892542
25
2.0
26
82
10
63
40
5
3
50
1.45
87898662--87898693
6
5.3
6
92
0
55
12
65
3
18
1.38
87899430--87899469
13
3.1
13
96
0
71
65
0
35
0
0.93
87899804--87900239
101
4.3
101
83
10
513
28
0
15
54
1.46
87905316--87905342
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
87905316--87905350
15
2.3
15
90
0
52
77
5
0
17
0.96
87912598--87912655
27
2.1
27
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6
73
29
22
29
18
1.98
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21
1.9
22
90
5
66
70
0
0
29
0.87
87912765--87912806
12
3.7
12
78
21
54
71
0
0
28
0.86
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69
6.0
69
87
6
591
26
6
3
63
1.34
87916435--87916858
215
2.0
208
89
4
643
26
6
3
63
1.34
87917011--87917053
21
2.0
21
100
0
86
23
13
4
58
1.55
87917054--87917105
20
2.5
21
79
17
63
21
9
1
67
1.29
87928734--87928777
22
2.0
22
82
8
54
38
13
18
29
1.89
87929004--87929264
40
6.6
40
88
3
386
29
24
22
22
1.99
87929004--87929264
79
3.3
80
90
4
395
29
24
22
22
1.99
87929004--87929264
119
2.2
120
88
4
386
29
24
22
22
1.99
87937009--87937140
62
2.1
62
94
1
230
36
13
23
26
1.92
87939666--87939781
50
2.3
50
83
2
153
31
16
22
30
1.96
87939655--87939952
44
6.5
44
82
6
278
30
16
21
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87939747--87939963
87
2.5
88
84
6
282
31
16
21
29
1.95
87939699--87939952
131
1.9
134
81
8
311
30
16
21
31
1.95
87951954--87952348
73
5.6
72
85
9
523
27
5
3
63
1.31
87952200--87952299
21
4.3
23
68
18
73
24
5
3
68
1.24
87951954--87952348
69
5.7
69
88
5
528
27
5
3
63
1.31
87951955--87952348
208
1.9
207
90
4
598
27
5
3
63
1.32
87952523--87952577
21
2.7
20
81
13
67
18
12
3
65
1.40
87957876--87957925
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12
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22
0
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1.13
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1.9
35
81
0
82
44
4
13
38
1.64
87974294--87974392
37
2.7
37
83
9
105
44
3
3
49
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318