Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  69  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19972700--19973003
49
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49
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6
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1.88
19972705--19972982
89
3.0
89
90
6
421
29
8
32
28
1.88
19972754--19973003
138
1.8
138
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0
464
28
9
32
29
1.88
19972727--19973013
89
3.1
90
83
11
368
30
8
31
29
1.86
19973105--19973189
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37
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20
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19974951--19974992
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2.0
22
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1.88
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2.1
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0
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19976207--19976428
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21
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0
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0
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1.9
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24
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36
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2.2
17
90
0
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100
0
50
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0
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1.52
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18
80
0
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43
15
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1.68
19988143--19988194
18
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11
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30
1.67
19988316--19988436
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2.3
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2
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15
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16
2.1
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0
0
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0
0
52
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2.8
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133
34
24
15
25
1.95
19990401--19990534
44
3.1
42
82
8
135
34
23
16
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20011518--20011604
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3.6
24
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4
131
36
25
16
21
1.94
20011496--20011607
24
4.7
24
85
6
122
34
23
16
25
1.95
20013127--20013289
39
4.2
39
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0
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20
22
1.97
20016109--20016280
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1.8
93
96
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29
21
20
1.98
20016101--20016276
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3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
20023827--20023989
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
20027458--20027575
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
20027426--20027589
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71
100
0
328
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17
28
18
1.94
20031860--20032040
89
2.1
87
83
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222
35
19
8
35
1.83
20032039--20032150
10
11.8
10
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7
83
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1
3
31
1.22
20032045--20032150
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2.9
38
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13
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1
3
29
1.21
20032044--20032222
48
3.7
48
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3
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2.0
26
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0
1
67
1.02
20032436--20032508
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28
2
0
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1.03
20032433--20032508
38
2.0
40
84
10
104
30
2
0
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1.05
20045957--20045992
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2
100
0
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0
0
50
1.00
20048517--20048584
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34
97
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4
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1.61
20049886--20049992
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46
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7
110
32
15
28
23
1.95
20050070--20050202
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2.7
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162
29
21
26
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1.99
20057872--20058046
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3.7
46
79
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154
29
18
27
25
1.98
20060435--20060517
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27
100
0
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56
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1.62
20065350--20065380
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2
93
0
53
45
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0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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48
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28
28
16
26
1.97
20079257--20079537
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75
84
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22
22
28
1.99
20085875--20086054
75
2.4
75
85
0
227
27
22
20
28
1.99
20092255--20092439
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2.6
72
88
1
255
22
17
28
30
1.97
20092750--20093005
128
2.0
128
100
0
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15
36
1.80
20097052--20097137
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2.0
43
93
0
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1
19
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2
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0
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198
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1.96
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19
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0
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20
27
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100
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19
27
24
1.98
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28
20
27
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1.99
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2
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2
100
0
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0
0
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16
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12
37
18
1.88
20156913--20157106
50
3.9
50
88
0
298
29
18
28
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20161437--20161472
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2.0
18
100
0
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22
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5
38
1.77
20162920--20163000
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2.0
40
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20
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10
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32
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14
44
1.76
20166428--20166454
14
1.9
14
100
0
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44
14
14
25
1.84
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2.5
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75
4
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21
36
20
21
1.95
20168549--20168578
14
2.1
14
93
0
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63
6
16
13
1.50
20171272--20171429
40
4.0
40
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22
22
29
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1.99
20174540--20174645
42
2.5
42
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1
203
33
12
14
40
1.83
20174628--20174672
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
20180925--20181077
40
3.8
40
93
2
247
22
22
28
25
1.99
20186519--20186833
43
7.3
43
84
3
386
28
29
17
24
1.97
20186843--20186880
20
2.0
20
89
5
60
42
0
0
57
0.98
20188842--20188877
18
2.0
18
94
0
63
47
8
5
38
1.57
20189967--20190004
13
2.9
13
84
11
51
18
0
2
78
0.86
20189969--20190008
19
2.2
18
90
4
62
15
0
2
82
0.77
20189998--20190045
20
2.5
19
87
12
71
22
4
2
70
1.15
20190302--20190352
13
3.8
13
73
14
50
47
31
0
21
1.51
20191076--20191166
41
2.2
41
96
0
164
25
28
21
24
1.99
20191156--20191248
41
2.3
41
81
3
107
18
20
24
36
1.95
20191171--20191249
41
1.9
41
87
5
115
20
20
20
39
1.93
20194943--20195015
25
3.0
23
82
9
67
38
16
21
23
1.93
20205977--20206155
61
3.0
60
80
4
189
26
24
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20209205--20209250
2
23.5
2
95
4
85
50
0
0
50
1.00
20222236--20222309
31
2.4
31
88
0
103
36
43
1
18
1.59
20224796--20224905
28
4.0
27
75
12
98
22
27
20
30
1.98
20224804--20224929
56
2.2
56
85
2
173
24
29
18
27
1.98
20224829--20224929
28
3.6
28
77
10
125
24
30
15
28
1.96
20227729--20227772
3
14.7
3
100
0
88
68
0
0
31
0.90
20235121--20235172
19
2.8
19
97
2
97
78
21
0
0
0.74
20235128--20235169
15
2.8
15
85
10
59
80
19
0
0
0.70
20236569--20236610
21
2.0
22
85
4
59
66
14
19
0
1.25
20246430--20246516
21
4.0
23
77
10
92
37
25
21
14
1.92
20246612--20246656
24
2.0
22
82
8
54
33
26
0
40
1.57
20250712--20250828
56
2.1
56
98
0
225
38
19
5
35
1.77
20251539--20251908
183
2.0
185
90
2
591
36
22
17
23
1.94
20254128--20254167
19
2.1
19
86
9
55
60
5
0
35
1.19
20254532--20254665
62
2.2
59
81
5
162
41
3
4
50
1.40
20256257--20256310
3
18.3
3
86
3
74
68
1
29
0
1.00
20258278--20258328
19
2.7
20
84
9
70
50
1
0
47
1.12
20259451--20259512
26
2.7
22
82
12
63
17
22
4
54
1.61
20259450--20259503
26
2.1
26
92
0
90
16
20
3
59
1.52
20259645--20259689
21
2.1
21
95
0
81
51
4
28
15
1.63
20262867--20263124
129
2.0
129
99
0
507
36
12
13
38
1.82
20274368--20274422
26
2.1
26
100
0
110
27
10
3
58
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20279343--20279389
17
2.8
17
79
20
62
36
2
6
55
1.37
20282448--20282481
17
2.0
17
100
0
68
17
0
29
52
1.45
20284573--20284739
40
4.2
40
78
6
160
26
22
26
23
2.00
20286141--20286189
25
2.0
24
84
4
62
36
2
0
61
1.08
20286150--20286182
17
1.9
18
88
11
52
36
0
0
63
0.95
20289311--20289384
25
3.0
25
78
9
71
31
17
25
25
1.97
20295539--20295679
48
3.0
46
77
11
158
24
24
24
27
2.00
20298872--20298984
43
2.7
42
83
2
145
30
15
27
26
1.96
20309033--20309123
43
2.1
43
87
0
128
26
16
28
28
1.97
20312754--20312808
20
2.8
20
86
5
76
29
14
16
40
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318