Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  273  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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0
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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10
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10
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217
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23
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1.90
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192
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23
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86660125--86660158
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34
0
10
55
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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15
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1.41
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13
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36
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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10.0
5
80
11
52
54
3
0
41
1.18
86726012--86726067
12
4.5
12
81
16
69
53
3
0
42
1.18
86728811--86728875
21
3.1
21
75
14
64
58
10
7
23
1.57
86733214--86733323
26
4.2
26
95
0
175
36
24
6
32
1.81
86735965--86736041
31
2.5
30
75
8
75
37
12
2
46
1.56
86736770--86736991
107
2.1
107
95
0
399
40
16
9
34
1.80
86737226--86737279
17
3.1
17
74
12
56
66
5
1
25
1.23
86738239--86738290
18
2.7
19
82
11
63
38
0
3
57
1.17
86738202--86738288
19
4.3
20
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0
2
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1.13
86738478--86738525
7
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0
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45
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10
14
1.78
86738475--86738531
7
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7
94
0
60
49
26
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15
1.74
86744674--86744723
23
2.1
24
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10
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40
6
4
50
1.46
86746422--86746466
21
2.1
22
83
4
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55
20
4
20
1.60
86749804--86749847
22
2.0
22
86
0
61
43
0
4
52
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86749984--86750028
22
2.0
22
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8
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40
4
0
55
1.20
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33
2.0
33
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0
105
21
22
39
16
1.92
86752598--86752773
46
3.8
46
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12
198
20
20
30
28
1.98
86752594--86752766
93
1.9
93
93
0
301
20
20
30
27
1.98
86762084--86762122
15
2.6
15
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0
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58
20
12
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1.58
86762063--86762122
30
2.0
30
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56
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11
1.67
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2.2
14
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0
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22
22
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1.92
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46
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22
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0
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0
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0
0.37
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0
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0
15
0
0.62
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10
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0
16
0
0.65
86779375--86779475
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2.2
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113
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1
0
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1.10
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27
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55
1
0
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1.07
86782965--86783002
20
1.9
20
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13
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42
1.57
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2.5
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42
3
3
50
1.36
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44
2.4
44
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3
144
29
23
13
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1.93
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44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
86801082--86801189
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
86807852--86807891
5
7.8
5
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5
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20
0
0
80
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26
2.0
26
84
0
66
25
0
1
72
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86810610--86810740
46
2.8
45
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12
142
21
20
25
32
1.97
86818698--86818863
46
3.6
46
80
8
162
23
29
19
27
1.98
86819746--86819790
20
2.3
20
81
14
58
28
28
15
26
1.96
86819757--86819800
19
2.2
20
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4
54
34
25
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1.96
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2.1
46
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0
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22
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19
2.1
19
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0
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0
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2.0
21
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20
30
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26
2.0
26
96
0
95
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11
23
28
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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