Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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28
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19
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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82
8
250
29
17
18
35
1.93
1720742--1720772
15
2.1
15
93
0
53
16
9
6
67
1.39
1720831--1720857
14
1.9
14
100
0
54
14
18
7
59
1.58
1720562--1720930
89
4.1
88
84
5
442
28
17
18
35
1.93
1720845--1721397
76
7.1
75
78
15
415
29
17
20
32
1.96
1720921--1721182
91
2.9
89
88
4
379
29
16
17
36
1.92
1721087--1721121
14
2.5
14
90
0
52
25
11
5
57
1.56
1721196--1721319
63
2.0
63
93
0
212
34
18
24
22
1.96
1721120--1721395
139
2.0
138
85
4
376
31
18
23
26
1.98
1721257--1721397
74
1.9
75
89
2
221
32
19
21
25
1.97
1721424--1721566
74
1.9
75
86
2
207
30
20
22
25
1.98
1721591--1721736
75
1.9
76
87
2
213
32
18
21
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1721251--1722066
167
4.9
167
91
2
1190
29
20
19
30
1.97
1721650--1721828
93
1.9
91
83
6
227
26
20
19
33
1.96
1721761--1721903
75
1.9
75
88
0
214
29
18
21
30
1.97
1721251--1722066
337
2.4
335
89
3
1212
29
20
19
30
1.97
1721836--1722006
92
1.9
92
87
0
252
28
20
19
30
1.97
1721740--1722243
244
2.1
241
83
5
620
27
18
19
33
1.95
1723228--1723266
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
1724011--1724055
11
4.1
11
82
0
54
35
0
4
60
1.17
1724186--1724242
15
3.8
15
72
6
53
40
7
3
49
1.47
1725657--1725681
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
1726006--1726076
34
2.1
35
81
7
92
40
39
2
16
1.64
1726189--1726226
7
5.4
7
90
0
58
26
10
26
36
1.89
1726189--1726268
19
4.1
20
80
6
74
23
6
30
40
1.79
1726196--1726262
13
5.0
14
75
10
68
23
5
31
38
1.79
1726222--1726275
6
8.5
6
76
11
54
20
1
35
42
1.63
1726222--1726275
13
4.2
13
79
11
58
20
1
35
42
1.63
1726189--1726271
26
3.1
26
81
6
78
22
6
30
40
1.78
1726228--1726283
26
2.1
27
90
3
87
21
3
35
39
1.71
1730186--1730263
31
2.6
30
86
6
104
42
12
8
35
1.75
1741723--1741766
18
2.4
18
80
0
52
25
0
4
70
1.06
1741909--1741969
29
2.2
27
82
11
70
40
6
3
49
1.45
1747295--1747325
16
2.0
15
93
6
53
51
19
6
22
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1747516--1747565
22
2.2
24
82
7
59
62
6
0
32
1.20
1748851--1748886
16
2.2
16
95
0
63
52
8
0
38
1.32
1749359--1749424
31
2.2
30
83
2
78
39
0
9
51
1.34
1749359--1749439
31
2.7
30
79
5
74
41
1
8
48
1.42
1750445--1750484
20
2.0
20
95
0
71
52
7
10
30
1.62
1756094--1756118
11
2.3
11
100
0
50
48
0
0
52
1.00
1758661--1758687
14
1.9
14
100
0
54
55
0
0
44
0.99
1764457--1764567
46
2.4
46
77
7
111
47
2
0
49
1.15
1764482--1764528
17
2.7
18
78
15
55
44
2
0
53
1.12
1764512--1764569
27
2.1
27
84
6
73
51
1
0
46
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318