Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  295  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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35
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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23
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19
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10
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92749176--92749236
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89
1.9
89
97
0
316
28
18
21
31
1.97
92752052--92752431
177
2.1
178
86
4
527
29
18
21
30
1.97
92752603--92752767
80
2.1
80
100
0
330
31
9
4
53
1.54
92756353--92756439
45
1.9
45
86
4
122
31
12
9
47
1.73
92756503--92756570
27
2.5
27
77
20
70
39
1
8
50
1.43
92765453--92765501
25
2.0
25
87
0
71
51
20
6
22
1.69
92767318--92767387
25
2.8
25
76
4
61
50
2
1
45
1.25
92774046--92774088
16
2.6
16
85
3
59
23
6
6
62
1.45
92785006--92785178
93
1.9
93
96
0
319
27
31
20
20
1.97
92784999--92785174
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3.8
46
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10
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28
31
20
19
1.97
92785007--92785193
46
4.0
44
70
21
125
28
30
20
20
1.98
92787693--92787781
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
92787693--92787772
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
92787704--92787781
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92790003--92790105
50
2.1
50
100
0
206
32
20
1
45
1.62
92790768--92790945
46
3.8
46
80
4
223
27
29
21
21
1.98
92790775--92790947
93
1.9
93
95
0
310
26
30
21
21
1.98
92795471--92795528
3
19.3
3
100
0
116
67
0
0
32
0.91
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30
3.5
30
90
0
165
20
27
27
23
1.99
92811866--92811992
48
2.7
47
82
6
139
29
14
22
33
1.94
92811779--92812023
43
5.4
47
80
7
219
28
15
24
30
1.96
92813662--92813793
35
3.6
37
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12
148
33
22
11
32
1.90
92817986--92818157
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
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30
3.0
30
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8
101
57
15
16
10
1.65
92820538--92820617
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
92820549--92820626
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
92823537--92823708
93
1.8
93
96
0
317
27
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22
20
1.98
92823529--92823704
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
92829442--92829573
35
3.6
37
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12
148
33
22
11
32
1.90
92832774--92832830
22
2.6
22
88
0
69
14
26
29
29
1.95
92833735--92833768
17
1.9
18
88
5
52
41
11
11
35
1.78
92833758--92833801
18
2.4
18
84
0
52
38
11
15
34
1.84
92837489--92837539
24
2.1
24
100
0
102
23
19
3
52
1.62
92840105--92840156
23
2.3
23
90
6
79
50
17
1
30
1.57
92840136--92840187
17
3.1
17
77
0
59
38
19
9
32
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92841516--92841557
15
2.9
14
82
10
57
35
0
11
52
1.38
92841932--92842012
21
3.7
22
77
6
67
14
19
27
38
1.91
92843708--92843740
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
92844026--92844574
46
11.9
46
90
0
778
21
24
13
41
1.88
92846406--92846449
2
22.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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26
3.2
26
96
0
146
31
6
25
36
1.81
92851048--92851180
27
5.0
27
80
14
159
18
25
21
33
1.96
92851042--92851180
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2.6
54
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219
18
25
21
33
1.96
92851056--92851202
27
5.5
27
81
11
135
20
25
20
33
1.97
92856383--92856489
26
4.2
26
93
1
189
32
7
24
35
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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