Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  70  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20315977--20316099
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25
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30
1.97
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4.7
19
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13
10
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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37
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37
1.79
20365871--20365971
36
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36
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21
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3.4
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2
520
30
27
21
21
1.98
20371844--20372228
38
10.1
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2
511
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21
21
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22
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20395498--20395594
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206
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22
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19
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35
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20402698--20402764
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100
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30
1.95
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26
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1.95
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2.0
56
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144
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1.8
188
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0
528
28
26
14
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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20417308--20417514
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80
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23
28
24
2.00
20431556--20431754
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2.4
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307
23
23
29
24
1.99
20431556--20431780
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23
28
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28
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20
23
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20463406--20463460
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19
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6
126
36
15
7
40
1.75
20475029--20475081
22
2.5
21
73
8
54
71
3
0
24
1.02
20483581--20483755
86
2.0
86
97
0
332
34
16
16
33
1.90
20488503--20488538
2
17.5
2
94
5
63
47
2
0
50
1.15
20488620--20488676
22
2.6
22
80
2
71
33
19
29
17
1.95
20491251--20491299
23
2.1
23
88
7
73
71
0
2
26
0.97
20500480--20500766
136
2.1
138
92
1
488
31
24
18
25
1.97
20501014--20501066
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
20502444--20502481
5
7.6
5
82
11
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78
0
2
18
0.86
20502445--20502475
9
3.3
9
91
8
53
77
0
3
19
0.90
20507374--20507457
26
3.2
26
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3
152
40
22
3
33
1.71
20507374--20507440
13
5.2
13
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25
52
41
20
4
32
1.73
20510583--20510633
24
2.1
25
85
7
70
70
1
1
25
1.08
20519261--20519321
22
2.9
22
78
4
72
32
21
27
18
1.96
20520996--20521033
2
19.0
2
94
0
67
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20521909--20521954
22
2.1
22
84
8
58
67
0
2
30
1.03
20527253--20527408
47
3.3
47
90
1
231
32
8
30
28
1.87
20529616--20529657
20
2.1
20
100
0
84
47
0
23
28
1.52
20540316--20540476
29
5.6
29
87
1
207
26
32
16
25
1.96
20545901--20545961
23
2.6
22
87
10
77
31
1
0
67
1.01
20545988--20546104
33
3.7
30
75
19
96
29
3
5
62
1.33
20560727--20560785
30
2.1
27
84
9
73
62
5
6
25
1.41
20560829--20560889
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21
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60
3
3
32
1.29
20560935--20560970
17
2.1
17
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0
54
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2
0
33
1.08
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4.0
81
94
0
518
28
19
19
31
1.96
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119
2.7
119
89
1
474
29
19
17
33
1.95
20562996--20563161
84
2.0
85
87
1
244
27
21
18
33
1.96
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20
1.9
20
100
0
76
31
31
5
31
1.80
20574216--20574259
16
2.6
17
79
13
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25
2
2
70
1.10
20574336--20574387
20
2.8
19
83
11
72
36
5
0
57
1.23
20576263--20576323
29
2.1
29
84
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79
62
4
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26
1.40
20576367--20576417
20
2.4
22
83
6
70
64
0
1
33
1.05
20576369--20576417
23
2.2
22
85
10
64
63
0
2
34
1.06
20578436--20578730
44
6.7
44
88
1
430
30
14
26
28
1.95
20579061--20579093
17
1.9
17
93
0
57
69
6
6
18
1.30
20579686--20579722
17
2.2
17
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13
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5
2
10
81
0.96
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29
3.2
28
72
20
70
30
3
4
62
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20580470--20580587
32
3.6
31
76
16
105
27
4
5
63
1.34
20594614--20594999
44
8.8
44
89
2
553
30
14
26
27
1.95
20595283--20595315
17
1.9
17
93
0
57
69
6
6
18
1.30
20597216--20597285
27
2.5
28
95
2
124
30
27
14
28
1.95
20604250--20604317
27
2.5
27
90
2
109
30
25
14
29
1.95
20605346--20605383
17
2.3
17
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5
5
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20606113--20606229
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3.7
30
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1.33
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2.0
16
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0
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2
60
32
19
26
21
1.97
20612130--20612158
13
2.1
14
93
6
51
41
3
6
48
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318