Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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Period
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Indices
Period
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1.97
93015112--93015151
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
93028354--93028396
20
2.2
20
86
0
59
48
0
4
46
1.22
93031670--93031711
19
2.2
20
82
4
50
40
4
16
38
1.70
93040676--93040745
29
2.4
29
95
0
131
61
4
12
21
1.48
93047854--93047904
23
2.3
22
80
6
57
13
19
19
47
1.83
93052426--93052591
35
4.6
35
83
7
197
29
10
25
34
1.89
93052437--93052553
40
3.0
40
85
10
140
29
10
25
35
1.89
93052426--93052596
75
2.4
75
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5
210
29
10
25
34
1.89
93054126--93054263
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28
15
26
1.96
93054126--93054241
40
2.8
42
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6
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28
28
14
28
1.95
93054084--93054270
81
2.3
83
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197
34
27
13
24
1.93
93059327--93059361
4
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4
100
0
70
25
0
22
51
1.48
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19
2.5
19
83
13
62
74
0
6
19
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93060527--93060587
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2.1
29
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6
70
68
0
11
19
1.19
93060562--93060606
6
7.3
6
80
5
54
75
0
6
17
1.01
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35
2.0
35
100
0
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11
16
29
1.83
93070964--93071090
42
3.0
42
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6
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27
27
14
29
1.96
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31
4.8
31
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3
210
25
25
20
28
1.99
93071267--93071395
50
2.5
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5
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25
22
15
36
1.93
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5
100
0
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0
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1.41
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0
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0
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0
0
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1.00
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2.1
21
100
0
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4
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3.0
26
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41
19
20
19
1.91
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3.3
25
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40
20
19
19
1.91
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25
3.3
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40
20
19
19
1.91
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1.9
31
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0
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15
20
1.88
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26
3.0
26
85
7
106
39
17
21
20
1.92
93088459--93088541
25
3.3
25
84
5
105
39
19
20
20
1.92
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2.0
31
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0
106
41
25
12
19
1.87
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90
2.0
91
84
2
240
37
20
7
33
1.82
93091226--93091312
10
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10
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14
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57
0
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39
1.16
93091425--93091472
18
2.7
18
87
3
71
50
6
14
29
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93091593--93091639
21
2.3
21
96
3
87
38
14
4
42
1.66
93091685--93091739
9
5.9
9
76
16
58
69
5
0
25
1.10
93091681--93091741
20
3.2
20
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90
65
4
0
29
1.13
93092005--93092139
8
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8
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19
52
25
1
3
69
1.13
93092066--93092110
24
1.9
24
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20
2
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73
1.11
93091968--93092101
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2.2
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163
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2
1
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10
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2
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0
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0
0
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29
2
2
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1.16
93099508--93099543
18
2.0
18
88
0
54
27
13
13
44
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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