Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  13  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
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154
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16
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
19
89
0
58
44
0
2
52
1.14
3544960--3545007
18
2.7
18
78
9
62
41
2
0
56
1.11
3545996--3546038
20
2.1
21
83
8
54
53
0
13
32
1.41
3549877--3549905
14
2.0
15
93
6
51
72
13
6
6
1.26
3551538--3551598
30
2.0
30
100
0
122
39
18
9
32
1.83
3559191--3559401
98
2.1
99
86
6
309
50
3
2
43
1.33
3561852--3561912
21
2.9
21
79
13
63
34
0
18
47
1.49
3562709--3562903
45
4.3
45
84
2
239
20
17
21
40
1.91
3562883--3562907
6
4.2
6
100
0
50
16
16
16
52
1.76
3563083--3563272
18
10.6
18
74
14
142
34
12
15
36
1.86
3563071--3563352
36
7.6
36
69
15
155
35
12
15
35
1.86
3563071--3563272
71
2.8
72
79
8
180
35
12
15
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3563137--3563365
18
12.4
18
67
10
68
36
12
14
36
1.84
3585595--3585685
21
4.5
21
69
27
65
45
2
2
50
1.26
3588636--3588673
19
2.0
19
100
0
76
31
21
5
42
1.75
3588888--3588936
25
2.0
25
84
4
64
26
20
28
24
1.99
3593887--3593946
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
3593917--3593972
21
2.7
21
83
8
62
69
5
0
25
1.09
3598873--3598913
20
2.0
21
85
4
57
43
0
0
56
0.99
3599374--3599406
14
2.3
15
89
5
50
57
0
0
42
0.98
3605312--3605354
18
2.5
17
82
14
52
53
2
18
25
1.56
3606191--3606237
16
3.1
15
81
6
51
59
0
4
36
1.17
3606191--3606229
16
2.5
16
87
4
53
56
0
5
38
1.22
3610704--3610736
12
2.8
12
95
0
57
36
12
0
51
1.39
3610829--3610891
27
2.3
27
94
0
108
6
26
19
47
1.73
3619572--3619641
3
22.0
3
88
8
79
62
4
0
32
1.14
3619716--3619798
3
27.3
3
71
20
50
63
1
3
31
1.19
3619735--3619797
27
2.4
27
84
7
76
63
1
4
30
1.24
3620303--3620388
30
2.9
30
92
3
147
25
6
51
16
1.69
3620957--3621105
43
3.4
42
71
14
140
18
20
22
37
1.94
3620910--3621935
86
11.9
86
83
6
980
20
23
20
35
1.96
3620915--3621319
44
9.4
44
67
15
202
18
22
21
37
1.94
3621205--3621450
43
5.7
43
69
8
185
21
22
21
34
1.96
3620900--3621937
173
6.0
172
82
6
955
20
23
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3621204--3621880
44
15.7
43
67
12
237
20
23
21
34
1.97
3633587--3633622
2
18.0
2
88
0
54
50
0
2
47
1.15
3633974--3634056
3
27.3
3
73
20
59
65
1
3
30
1.17
3633974--3634057
12
6.8
12
77
16
75
65
1
3
29
1.17
3633979--3634038
18
3.2
18
82
13
75
63
1
3
31
1.20
3634295--3634327
12
2.8
12
86
13
50
81
0
12
6
0.85
3635716--3635793
39
2.0
39
100
0
156
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5
7
51
1.53
3637876--3637959
28
2.9
28
83
3
105
29
0
3
66
1.08
3642696--3642758
29
2.1
29
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74
31
3
3
61
1.27
3643048--3643128
31
2.7
30
73
21
78
28
11
6
54
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318