Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  45  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12589705--12589786
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0
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12591455--12591558
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2.5
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2
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4.4
25
71
8
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31
3
3
61
1.30
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26
2.1
26
82
0
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3
3
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28
14
28
28
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5
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4.8
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305
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12615588--12615674
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2.1
42
100
0
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18
5
34
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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24
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2.0
162
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46
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4.1
47
93
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30
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30
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31
1.86
12710917--12711267
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1.8
192
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1
632
30
30
7
31
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
42
92
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2
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1.23
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12757745--12757803
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12.5
48
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801
32
7
29
29
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12773214--12773250
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2.1
18
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0
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0
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114
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2.0
210
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29
29
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29
30
1.85
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3.8
36
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251
23
20
32
24
1.98
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33
1
3
61
1.23
12777109--12777178
16
4.1
17
77
18
65
35
1
2
60
1.21
12777118--12777176
20
3.2
18
83
11
66
33
1
3
61
1.23
12777118--12777176
10
6.3
9
74
18
50
33
1
3
61
1.23
12777114--12777195
36
2.4
33
78
9
85
35
3
2
58
1.29
12777227--12777321
44
2.2
42
80
12
97
30
4
3
62
1.30
12781056--12781263
48
4.4
48
73
11
169
35
15
22
26
1.94
12781042--12781216
94
1.9
93
84
7
239
35
15
22
26
1.94
12782103--12782210
26
4.2
26
89
0
171
33
6
23
37
1.80
12783819--12783949
27
4.9
27
83
8
160
17
22
23
35
1.95
12783819--12783949
54
2.4
54
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1
210
17
22
23
35
1.95
12786480--12786546
32
2.1
32
97
0
125
37
13
13
35
1.84
12786877--12786990
48
2.4
47
82
7
133
37
13
21
28
1.90
12796295--12796336
22
1.9
22
95
0
75
21
19
14
45
1.85
12796526--12796572
21
2.3
21
79
20
55
23
4
12
59
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12801069--12801107
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
12801546--12801659
55
2.1
56
81
8
135
35
21
23
20
1.96
12801571--12801659
27
3.2
28
82
7
101
32
22
23
21
1.98
12801766--12801858
28
3.3
28
93
0
159
31
7
27
33
1.85
12811873--12812073
80
2.5
80
87
3
314
26
26
22
23
2.00
12811857--12812061
40
5.2
40
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2
281
26
26
22
23
2.00
12818687--12818904
40
5.5
40
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2
334
25
28
22
23
1.99
12826705--12826858
40
3.8
40
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1
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27
28
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21
1.99
12833480--12833526
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2.3
20
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0
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0
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2.3
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6
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11
5
5
77
1.11
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1.9
30
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17
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3
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1.18
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2
20.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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2.6
24
100
0
126
20
17
26
34
1.95
12852942--12852979
2
19.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
37
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0
139
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12
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1.86
12861477--12861551
28
2.8
27
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15
75
38
1
1
58
1.15
12861503--12861589
16
5.1
17
70
21
58
35
4
2
57
1.32
12861599--12861680
44
1.9
42
82
9
103
35
4
1
58
1.27
12861564--12861762
22
8.9
22
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18
56
29
6
2
62
1.30
12861722--12861766
18
2.4
19
82
14
58
24
0
6
68
1.13
12872814--12872847
4
8.8
4
93
6
61
79
0
0
20
0.73
12875481--12875556
28
2.8
28
74
9
77
38
1
1
59
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12875508--12875594
16
5.1
17
70
21
58
35
4
2
57
1.32
12875641--12875708
35
1.9
36
85
8
95
30
4
2
61
1.30
12875689--12875777
24
3.9
22
71
18
56
24
4
3
67
1.25
12875735--12875783
20
2.5
20
80
9
57
24
0
6
69
1.11
12886164--12886371
79
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190
24
30
23
22
1.99
12886264--12886371
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2.7
40
86
0
135
21
30
25
23
1.99
12896286--12896453
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
12902494--12902832
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123
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0
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10
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1.90
12902801--12903044
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6.1
40
88
1
301
24
21
26
27
1.99
12904403--12904583
40
4.5
40
91
0
281
23
20
30
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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