Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  287  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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149
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32
1.28
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80
0
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5
38
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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28
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2.3
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0
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22
9
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.31
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2.7
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51
39
2
18
39
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90841465--90841497
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2.0
17
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15
0
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72
1.12
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21
20
1.95
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128
2.0
130
82
7
317
34
21
22
21
1.97
90860179--90860538
43
8.4
42
73
8
260
36
22
20
20
1.95
90860179--90860595
87
4.8
86
87
5
522
36
21
21
20
1.95
90872575--90872610
17
2.1
17
100
0
72
27
16
16
38
1.90
90876460--90876502
22
2.0
22
100
0
86
41
13
9
34
1.77
90876734--90876761
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
90882401--90882442
21
2.0
22
85
4
59
40
9
28
21
1.84
90886048--90886088
12
3.7
12
75
18
52
51
19
19
9
1.74
90886044--90886092
21
2.3
21
100
0
98
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20
8
1.66
90891675--90891700
10
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0
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19
1.95
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1
28.0
1
100
0
56
100
0
0
0
0.00
90895576--90895646
11
6.5
11
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12
67
67
2
1
28
1.13
90895585--90895632
15
3.1
15
77
16
53
72
2
0
25
0.95
90899241--90899300
30
2.0
30
87
6
86
36
8
26
28
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90899721--90899898
47
3.8
45
76
9
187
23
20
26
29
1.99
90912993--90913054
30
2.1
30
87
6
90
37
8
25
29
1.85
90913474--90913603
47
2.8
46
94
1
215
20
20
29
30
1.98
90913475--90913603
46
2.8
47
93
1
215
20
20
29
29
1.98
90919167--90919297
29
4.5
29
88
0
163
29
15
31
23
1.95
90927272--90927402
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4.5
29
88
0
163
29
15
31
23
1.95
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2.6
18
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9
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0
8
18
1.08
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2
0
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0.98
90933822--90933892
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1.15
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21
12
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1.51
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1.9
57
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3
177
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4
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17
2.0
17
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0
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20
11
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19
2.7
20
85
8
63
19
11
9
59
1.59
90936090--90936163
21
3.5
22
80
5
73
16
17
5
60
1.53
90936107--90936158
22
2.5
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19
21
1
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1.50
90936314--90936358
20
2.2
20
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20
15
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1.60
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19
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19
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18
54
23
11
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21
3.8
19
77
14
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22
14
2
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1.45
90936863--90936950
43
2.1
43
80
6
99
18
12
6
62
1.51
90936943--90936990
21
2.3
21
75
7
53
25
12
4
58
1.52
90938578--90938655
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2.3
33
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28
24
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50
2.0
50
97
0
187
34
16
15
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90944590--90944687
50
2.0
50
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0
187
34
16
15
33
1.90
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50
2.0
50
97
0
187
34
16
15
33
1.90
90948198--90948295
50
2.0
50
97
0
187
34
16
15
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1.90
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49
2.0
50
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1
193
35
18
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33
1.90
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2.0
50
98
0
193
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17
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18
2.3
18
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26
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0
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0
0
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2
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225
39
0
59
0
1.07
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6
22.8
6
76
11
79
29
0
69
0
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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