Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  5  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
0
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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22
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2.1
42
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8
124
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19
17
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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25
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1.19
1481674--1481848
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0
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0
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0
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2.0
22
100
0
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50
13
13
22
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1491096--1491155
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2.0
31
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3
86
38
10
11
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19
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0
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23
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0
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1516727--1516776
22
2.3
21
79
3
55
46
2
2
50
1.24
1518905--1518961
27
2.2
25
84
6
69
31
0
10
57
1.32
1521175--1521270
35
2.7
35
77
16
90
54
2
1
42
1.19
1521312--1521374
18
3.4
19
75
20
62
63
0
6
30
1.19
1529476--1529641
85
2.0
84
90
1
260
31
7
36
24
1.83
1529865--1529907
21
2.1
20
91
4
68
16
0
6
76
0.99
1542029--1542054
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
1542070--1542164
45
2.2
44
88
3
138
60
4
2
33
1.28
1550115--1550171
27
2.1
27
100
0
114
26
35
24
14
1.93
1550515--1550730
107
2.0
108
98
0
416
41
9
5
43
1.60
1551610--1551717
26
4.2
26
97
0
180
32
5
25
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1553160--1553234
26
2.8
26
77
4
69
37
18
12
32
1.88
1553338--1553450
27
4.2
27
82
3
120
17
23
22
36
1.95
1553336--1553450
54
2.1
54
87
3
160
17
23
22
36
1.95
1558364--1558399
8
4.9
7
87
12
54
13
2
0
83
0.76
1558359--1558413
23
2.4
24
78
9
60
21
7
0
70
1.11
1560184--1560214
15
2.1
15
100
0
62
25
0
6
67
1.14
1563727--1563756
12
2.4
13
94
5
53
86
0
13
0
0.57
1564956--1565558
45
13.6
44
65
13
182
28
18
23
30
1.97
1564957--1565607
133
4.9
133
90
1
950
28
18
23
30
1.98
1567331--1567502
46
3.7
46
76
13
190
29
27
20
22
1.99
1567336--1567506
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
22
1.99
1567924--1567983
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
1570552--1570602
26
2.0
26
84
0
66
33
13
1
50
1.53
1572616--1573024
46
8.9
46
91
2
563
40
14
24
20
1.90
1573303--1573335
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
1574234--1574265
15
2.2
14
94
5
55
25
0
0
75
0.81
1575582--1576044
131
3.5
131
80
4
488
34
17
18
29
1.94
1582761--1582816
27
2.2
25
87
9
78
55
16
8
19
1.67
1584357--1584386
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
1585097--1585151
28
1.9
29
82
10
69
21
7
1
69
1.23
1586113--1586152
18
2.2
18
86
8
55
35
2
5
57
1.34
1586104--1586175
31
2.3
31
80
4
101
31
5
11
51
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1594962--1595008
2
23.5
2
100
0
94
51
0
0
48
1.00
1599798--1599839
17
2.5
17
84
7
50
76
2
2
19
1.01
1601940--1601994
28
2.0
28
100
0
110
52
18
7
21
1.69
1604657--1604685
15
2.0
15
93
6
51
62
0
37
0
0.96
1604729--1604766
5
7.6
5
93
0
67
76
0
23
0
0.79
1608433--1608463
2
15.5
2
100
0
62
0
51
0
48
1.00
1610271--1610300
13
2.3
13
94
0
51
0
10
3
86
0.67
1612441--1612799
119
3.0
119
92
0
594
33
18
18
29
1.94
1612723--1612957
83
2.8
83
94
0
407
31
21
21
25
1.98
1613829--1613881
28
1.9
27
84
3
70
26
26
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318