Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  218  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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28
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114
29
13
26
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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28
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114
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13
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1.94
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1.97
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18
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1.98
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331
28
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18
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1.98
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20
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16
32
16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
68783398--68783462
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26
1.94
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21
2.5
19
83
12
55
24
28
32
14
1.94
68815896--68815938
16
2.7
16
81
0
50
51
18
20
9
1.74
68816154--68816268
29
4.0
29
83
5
153
30
16
29
23
1.96
68819823--68819911
45
2.0
45
97
0
169
37
19
24
19
1.94
68821541--68821588
14
3.1
15
88
8
62
27
0
6
66
1.15
68825806--68825861
25
2.3
24
81
3
67
35
1
1
60
1.17
68825822--68825866
21
2.1
21
84
8
56
37
2
2
57
1.23
68827008--68827045
20
1.9
20
88
0
58
65
10
2
21
1.35
68828853--68828885
17
1.9
18
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42
6
3
48
1.43
68834661--68835177
126
4.1
125
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1
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28
15
16
38
1.90
68834715--68835177
251
1.8
252
84
1
642
28
16
16
38
1.90
68835233--68835343
34
3.3
33
81
6
143
42
15
0
41
1.53
68835449--68835496
24
2.0
24
83
0
60
58
29
2
10
1.43
68836590--68836627
8
4.9
8
80
6
51
44
0
0
55
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68837570--68837711
40
3.6
40
78
10
148
25
17
25
31
1.97
68841483--68841610
10
12.8
10
69
17
70
62
1
5
30
1.27
68841483--68841553
21
3.5
21
77
9
67
64
0
4
30
1.12
68841483--68841697
20
10.9
20
64
15
67
60
1
5
33
1.29
68842654--68842794
9
14.3
10
70
14
73
31
2
0
64
1.13
68842651--68842715
29
2.2
29
86
5
96
30
3
1
64
1.18
68842683--68842727
11
4.2
11
80
5
56
24
2
2
71
1.09
68842683--68842737
21
2.6
21
88
5
76
29
1
1
67
1.11
68842651--68842796
19
7.5
19
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2
0
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1.14
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29
3.3
29
78
10
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35
2
0
62
1.07
68842683--68842797
10
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10
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14
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33
1
0
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1.10
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22
1.9
22
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0
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30
19
19
30
1.96
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19
1.9
19
88
5
56
63
19
5
11
1.46
68847721--68847777
15
3.6
15
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9
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63
5
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0
1.17
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20
22
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13
2.5
13
100
0
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25
1.98
68856936--68856978
10
4.4
10
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5
61
62
6
2
27
1.33
68856965--68857002
17
2.2
18
86
13
53
60
2
5
31
1.33
68857642--68857675
9
3.8
9
88
0
50
32
2
2
61
1.26
68857735--68857813
35
2.2
35
80
12
90
36
5
0
58
1.20
68858299--68858332
2
17.0
2
93
0
59
47
0
0
52
1.00
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35
2.0
35
97
0
131
38
20
18
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68866669--68866706
2
19.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.4
19
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11
54
40
0
2
57
1.12
68867093--68867126
17
2.0
17
100
0
68
29
11
11
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1.76
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6
6.3
6
85
11
51
47
0
2
50
1.15
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14
100
0
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0
0
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0.83
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2.6
27
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2
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8
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1.63
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0
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23
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18
1.54
68886648--68886700
27
2.0
27
88
0
79
30
15
16
37
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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