Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  8  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1992594--1993688
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25.2
44
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1992660--1993381
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1262
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23
19
31
1.98
1992659--1993381
263
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1
1264
26
23
19
31
1.98
1993361--1993747
132
2.9
132
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0
749
26
23
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20
22
22
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1.9
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1.9
19
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0
65
0
13
0
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19
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5
51
0
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5
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51
0
0
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1.00
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11
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11
52
54
5
0
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1.24
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63
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1.21
2000948--2001030
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12
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1
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1.22
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0
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0
0
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2.9
29
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8
22
35
1.84
2018981--2019020
16
2.4
16
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53
27
5
12
55
1.58
2023740--2023796
23
2.5
23
81
13
64
42
1
1
54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2023835--2023871
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2.2
17
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4
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10
0
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1.38
2023835--2023897
16
4.0
16
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15
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0
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1.36
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2.1
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0
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1.00
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2.2
24
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3
0
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12
100
0
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0
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10
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1.9
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0
2
34
1.08
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1
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2
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1.9
22
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59
23
52
9
14
1.71
2049176--2049257
22
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21
77
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1
29
63
1.26
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3
29.3
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3
1
65
1.16
2049444--2049536
30
3.0
30
77
20
102
31
3
1
64
1.16
2049864--2049923
20
2.9
21
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12
52
33
3
8
55
1.47
2052349--2052395
19
2.5
19
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60
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19
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1.79
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6
6.3
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12
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13
36
0
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11
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33
0
1.37
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1.9
66
95
0
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32
19
12
35
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
22
19
1.96
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21.7
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21
21
20
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2
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21
19
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6.6
132
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1124
36
22
21
19
1.95
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175
4.4
175
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21
21
20
1.96
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277
28
22
21
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1.99
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0
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18
24
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1.98
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2.8
302
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1
1542
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18
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1.98
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174
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10
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30
18
24
26
1.98
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1.9
22
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9
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1.71
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1
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3
1
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1.16
2059724--2059813
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5
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2081585--2081639
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2081835--2081921
25
3.7
23
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5
6
32
1.50
2081857--2081921
25
2.8
24
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53
6
6
33
1.50
2081935--2082001
14
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14
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18
59
58
1
5
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1.32
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1.50
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25
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55
4
7
32
1.48
2081931--2082011
27
2.9
27
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12
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55
2
8
33
1.44
2082487--2082559
29
2.4
31
80
11
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39
20
1
38
1.61
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19
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17
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17
17
32
1.93
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22
2.4
22
84
12
65
72
3
0
24
1.01
2103704--2103792
29
2.9
30
76
17
94
39
21
1
38
1.61
2103993--2104026
14
2.5
14
90
4
52
73
14
2
8
1.19
2104231--2104272
19
2.2
20
86
4
59
4
11
7
76
1.15
2107582--2107622
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
2107847--2107892
12
3.8
12
97
0
83
71
0
0
28
0.86
2109205--2109272
9
7.7
9
75
9
50
66
1
2
29
1.15
2109200--2109233
17
2.1
17
88
5
52
67
0
0
32
0.91
2111136--2111183
23
2.1
23
84
7
62
62
0
4
33
1.14
2118933--2118979
3
15.7
3
95
0
85
63
0
2
34
1.06
2120890--2120994
50
2.1
50
98
0
201
20
8
25
45
1.79
2121731--2121781
3
17.0
3
100
0
102
33
0
33
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2128805--2128937
67
2.0
69
86
3
189
47
18
9
25
1.77
2129946--2130071
49
2.7
46
81
3
162
39
1
9
49
1.45
2134288--2134325
18
2.2
17
86
13
51
50
0
5
44
1.24
2134523--2134579
30
1.9
29
96
3
105
38
5
8
47
1.57
2135272--2135296
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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27
2.1
27
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3
67
43
5
1
49
1.36
2135931--2135993
15
4.0
15
73
16
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49
1
1
47
1.20
2139580--2139634
17
3.2
17
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12
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54
1
0
43
1.10
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13
2.1
13
100
0
54
40
0
14
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1.46
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12
2.1
12
100
0
50
40
0
0
60
0.97
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15
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15
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4
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23
0
0
76
0.79
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11
2.4
11
100
0
52
0
15
0
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0.62
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14
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14
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48
2
0
50
1.12
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35
1.9
35
84
6
91
74
1
10
13
1.14
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21
2.4
23
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8
10
25
1.63
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15
2.4
15
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0
54
41
11
5
41
1.64
2183779--2183843
27
2.4
27
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0
112
33
12
6
47
1.66
2183846--2183915
23
3.0
23
80
2
86
41
15
11
31
1.83
2192217--2192296
29
2.7
29
84
9
90
31
6
13
48
1.67
2193663--2193701
18
2.2
18
85
0
51
56
0
5
38
1.22
2195173--2195256
30
2.8
30
75
7
89
38
4
11
45
1.62
2205729--2205804
31
2.5
31
93
0
125
48
13
7
30
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2218376--2218467
43
2.1
43
93
0
157
32
19
3
44
1.67
2220425--2220458
18
1.9
18
88
5
52
52
0
5
41
1.25
2224615--2224659
9
4.6
9
82
17
54
20
4
2
73
1.11
2229998--2230049
20
2.4
21
73
20
54
59
3
0
36
1.16
2230009--2230049
20
2.0
20
86
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57
60
4
0
34
1.18
2237059--2237098
16
2.5
15
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11
53
67
0
5
27
1.11
2241068--2241098
15
2.1
15
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0
53
51
0
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2.3
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0
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1.08
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0
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27
2.0
27
100
0
110
60
3
0
36
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318