Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  318  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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98902274--98902425
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
99006849--99006913
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42
1.70
99018575--99018670
50
1.9
50
95
0
174
38
6
13
41
1.70
99018611--99018639
14
2.1
14
100
0
58
41
6
13
37
1.72
99019334--99019400
30
2.2
30
81
10
73
41
1
5
50
1.36
99020049--99020074
11
2.4
11
100
0
52
57
15
0
26
1.38
99031589--99031647
31
1.9
31
82
6
75
50
1
3
44
1.28
99032192--99032272
35
2.3
35
93
0
144
11
22
19
46
1.81
99038363--99038589
40
5.7
40
93
0
364
18
20
28
33
1.96
99046548--99046599
23
2.2
23
82
3
59
69
5
5
19
1.30
99050755--99050792
2
19.0
2
88
0
58
50
5
0
44
1.24
99050755--99050792
16
2.4
16
100
0
76
50
5
0
44
1.24
99053339--99053376
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
99054273--99054312
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
99054553--99054596
8
5.5
8
81
10
54
9
6
0
84
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99054553--99054596
15
2.7
17
86
6
56
9
6
0
84
0.79
99054886--99055544
44
15.4
44
92
5
1102
21
32
17
27
1.96
99054886--99055544
87
7.7
88
91
5
1102
21
32
17
27
1.96
99055754--99055872
61
1.9
65
89
6
192
38
10
15
34
1.83
99062725--99062806
26
3.2
26
89
0
128
34
7
21
36
1.82
99067068--99067116
22
2.2
22
100
0
98
26
28
18
26
1.98
99070190--99070227
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
99071400--99071435
8
4.5
8
89
10
56
11
2
0
86
0.68
99071400--99071435
15
2.2
16
90
9
56
11
2
0
86
0.68
99072708--99072794
18
4.6
18
74
17
70
27
5
4
62
1.38
99072824--99072907
43
1.9
45
83
13
113
25
9
2
63
1.37
99075645--99075695
18
3.1
18
75
18
56
62
0
3
33
1.13
99077258--99077299
20
2.1
20
100
0
84
28
4
35
30
1.78
99077668--99077823
82
1.9
82
90
5
253
27
19
18
33
1.96
99077960--99078254
111
2.7
111
96
1
538
24
22
21
32
1.98
99077750--99078254
222
2.2
222
86
8
664
26
21
19
33
1.97
99079568--99079607
20
2.0
20
100
0
80
30
15
15
40
1.87
99090303--99090355
19
2.8
20
86
8
67
56
0
3
39
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318

The End!