Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  24  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6327830--6327876
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6327831--6327877
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0
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2.3
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20
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3.5
24
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3
109
34
23
16
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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0
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15
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1.95
6377197--6377269
29
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0
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26
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20
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29
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1.99
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20
25
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163
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2.0
229
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2.0
17
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13
165
26
18
30
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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2.6
28
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16
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31
15
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6549866--6549905
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2.0
20
90
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42
22
0
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15
1
1.16
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1.9
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12
14
1.42
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50
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11
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59
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8
152
26
23
19
30
1.98
6606913--6606941
15
1.9
15
100
0
58
58
0
0
41
0.98
6607030--6607073
19
2.4
18
88
7
63
43
6
0
50
1.29
6609607--6609727
6
19.7
6
71
17
70
48
15
16
19
1.81
6609607--6609727
19
6.6
18
69
15
70
48
15
16
19
1.81
6609621--6609731
31
3.6
31
91
0
168
49
15
16
18
1.80
6609852--6609927
27
2.8
27
78
9
73
36
19
21
22
1.95
6610168--6610220
20
2.7
20
96
0
97
45
24
15
15
1.84
6610609--6610749
27
5.2
27
84
0
174
26
18
18
36
1.94
6610731--6610803
27
2.7
27
76
0
83
31
8
24
35
1.85
6610787--6611232
27
16.7
26
78
5
401
30
9
21
38
1.85
6610854--6611248
107
3.7
107
89
2
542
31
9
20
38
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6610851--6611232
27
14.3
27
81
1
446
31
9
20
38
1.84
6610868--6611232
54
6.8
54
87
1
502
30
9
20
39
1.84
6615907--6616026
59
2.0
59
91
0
195
20
15
30
33
1.94
6622551--6622592
22
1.9
22
85
9
59
66
9
7
16
1.42
6632706--6632790
42
2.0
42
93
0
143
24
18
21
35
1.96
6638165--6638227
31
2.0
31
93
6
110
15
25
19
39
1.91
6638557--6638687
60
2.2
60
80
5
158
35
12
18
33
1.88
6639551--6639591
16
2.4
17
84
16
57
65
7
0
26
1.18
6640378--6640431
21
2.5
22
80
14
60
48
3
1
46
1.30
6640820--6640858
21
1.9
20
89
5
60
48
0
0
51
1.00
6641174--6641213
11
3.6
11
82
0
53
22
15
5
57
1.57
6647416--6647445
6
5.0
6
91
0
51
66
20
0
13
1.24
6647458--6647498
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
6648916--6648963
26
1.9
24
83
8
60
12
6
8
72
1.26
6650093--6650154
31
2.0
31
93
0
106
48
11
14
25
1.77
6650990--6651025
11
3.4
11
84
7
56
77
11
2
8
1.08
6652041--6652142
11
9.5
11
66
17
54
23
1
5
68
1.22
6661982--6662032
21
2.4
21
81
15
61
68
7
0
23
1.15
6661993--6662154
23
7.0
22
68
14
62
62
2
4
30
1.27
6662059--6662130
32
2.3
30
83
11
83
62
2
4
30
1.28
6662073--6662132
27
2.2
27
79
5
68
60
1
3
35
1.23
6662184--6662242
3
19.0
3
74
19
50
61
3
1
33
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6662184--6662242
7
9.5
6
72
20
50
61
3
1
33
1.23
6662164--6662246
36
2.4
34
80
9
98
59
2
3
34
1.28
6662164--6662242
16
4.6
16
77
16
70
60
2
3
32
1.28
6662165--6662251
16
5.1
17
73
20
67
59
2
2
35
1.22
6663819--6664408
119
5.0
119
95
1
1033
30
19
17
33
1.95
6672116--6672160
12
3.8
12
77
11
56
17
33
13
35
1.89
6675876--6675927
21
2.4
21
78
15
61
69
5
0
25
1.10
6675887--6675928
10
4.6
9
80
14
50
73
2
0
23
0.94
6675896--6675943
25
2.0
24
83
4
60
68
2
2
27
1.11
6676082--6676140
3
19.0
3
74
19
50
61
3
1
33
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318