Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  36  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Indels
Score
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G
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(0-2)
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27
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25
1.99
10047683--10047849
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2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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22
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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46
3.8
44
80
8
183
21
19
30
28
1.97
10159941--10160092
27
5.7
27
88
0
189
42
20
7
30
1.79
10159935--10160092
54
2.9
54
87
2
212
41
20
7
31
1.80
10159941--10160164
81
2.8
80
77
7
204
40
20
8
30
1.83
10159941--10160164
54
4.2
54
78
4
211
40
20
8
30
1.83
10160076--10160150
27
2.8
27
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4
107
38
24
10
26
1.88
10160142--10160568
27
15.8
27
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3
547
27
22
9
40
1.85
10160520--10160579
27
2.2
27
84
0
75
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25
6
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1.82
10161817--10161864
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10161908--10161966
20
3.0
20
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0
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13
20
30
1.91
10162017--10162159
24
6.0
24
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4
209
28
22
22
26
1.99
10162017--10162159
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
10162017--10162160
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10162351--10162483
31
4.1
31
84
12
185
39
15
21
23
1.92
10162368--10162506
38
3.8
38
82
13
193
39
15
22
22
1.92
10162351--10162506
69
2.2
69
95
1
276
37
17
23
21
1.94
10167695--10167727
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
10173680--10173737
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1.9
30
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0
107
27
10
41
20
1.85
10175822--10175955
38
3.5
37
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4
151
17
19
26
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1.94
10175822--10175966
76
1.9
76
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0
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17
20
26
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1.94
10176933--10177018
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2.1
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2
23
1.34
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2.4
27
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5
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0
1
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1.01
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0
0
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2.1
37
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0
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5
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1.59
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28
3.3
28
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1
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13
34
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30
1.92
10189442--10189475
18
1.9
18
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5
61
55
5
11
26
1.58
10190203--10190251
20
2.5
20
80
6
55
65
2
8
24
1.31
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12
2.9
12
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0
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0
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0.58
10190876--10190905
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14
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0
10
0
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0.47
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20
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76
0
2
21
0.90
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10
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10
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2
7
21
1.27
10196217--10196430
9
22.0
9
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21
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30
3
2
63
1.25
10196217--10196384
10
17.2
10
67
20
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29
4
2
63
1.27
10196245--10196365
61
2.0
61
82
6
147
28
5
3
62
1.34
10196281--10196384
30
3.5
29
79
8
111
28
2
1
66
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10196242--10196376
30
4.5
29
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13
105
28
5
2
63
1.30
10196332--10196413
19
4.3
18
74
10
74
35
0
2
62
1.09
10196332--10196425
38
2.4
39
79
11
104
34
0
3
62
1.11
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30
2.5
30
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5
4
41
1.45
10202744--10202948
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2.0
101
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0
356
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1.92
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1.87
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15
10
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1.81
10227096--10227194
17
5.8
17
74
9
69
43
16
10
30
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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