Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  238  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74779093--74779153
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0
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74779090--74779351
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1.84
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1.9
180
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16
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74799190--74799305
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43
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29
26
17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
74800511--74800665
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1.97
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2.5
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1.95
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3.0
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4.2
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129
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12
18
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.5
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23
1.96
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267
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17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74942788--74942951
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26
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32
24
16
26
1.96
74972645--74972710
25
2.6
25
82
0
87
27
21
16
34
1.95
74975502--74975719
40
5.5
40
87
2
280
25
28
23
22
1.99
74978945--74979147
40
5.1
40
88
3
286
24
28
23
23
1.99
74980646--74980682
13
2.8
13
95
0
65
54
35
0
10
1.36
74987149--74987391
40
6.1
40
87
4
332
25
27
23
23
2.00
74989760--74989810
26
2.0
25
88
3
75
31
21
15
31
1.95
74998399--74998449
20
2.5
20
93
0
84
11
27
41
19
1.86
75005631--75005752
6
19.8
6
69
14
70
48
11
19
20
1.80
75005643--75005752
31
3.4
31
74
14
103
47
11
20
20
1.81
75005631--75005722
37
2.5
37
85
0
121
48
10
19
20
1.78
75005631--75005752
37
3.5
36
72
13
110
48
11
19
20
1.80
75006256--75006720
27
17.2
27
86
1
540
41
6
21
31
1.78
75006256--75006845
54
10.9
54
80
5
233
38
7
21
32
1.81
75006256--75006774
81
6.4
81
82
3
517
39
6
21
31
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75006699--75006863
27
6.2
26
74
8
118
28
10
23
38
1.87
75010423--75010486
27
2.4
27
74
10
67
35
12
25
26
1.91
75010643--75010784
27
5.3
27
84
3
178
22
22
21
33
1.98
75011206--75011230
9
2.8
9
100
0
50
20
36
24
20
1.95
75013342--75013489
40
3.7
40
92
1
235
24
22
28
25
1.99
75013342--75013509
40
4.2
40
89
0
230
23
21
28
26
1.99
75022532--75022605
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
75022589--75022663
28
2.6
28
78
2
87
22
20
36
21
1.96
75022532--75022663
58
2.3
57
80
3
131
25
17
33
24
1.96
75030400--75030470
29
2.5
29
93
4
119
26
15
30
26
1.96
75038589--75038687
28
3.5
28
84
4
101
28
27
15
29
1.96
75042098--75042169
31
2.3
31
95
0
126
33
13
4
48
1.62
75043335--75043382
13
3.2
16
70
24
50
50
0
0
50
1.00
75043363--75043410
23
2.1
23
84
7
62
58
0
6
35
1.23
75043786--75043841
22
2.5
22
85
0
67
21
25
32
21
1.98
75048127--75048189
8
8.0
8
75
8
58
58
0
3
38
1.14
75048150--75048189
15
2.8
15
88
7
57
65
0
5
30
1.14
75048228--75048269
14
2.9
14
89
10
59
69
2
26
2
1.13
75049037--75049084
18
2.7
18
93
0
87
4
39
0
56
1.19
75054891--75055300
206
2.0
206
93
0
703
32
19
23
25
1.98
75057926--75057969
22
2.0
22
82
8
54
36
0
2
61
1.09
75058392--75058516
64
2.0
64
81
7
152
32
4
9
52
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75061074--75061296
40
5.6
40
81
7
256
26
26
22
25
2.00
75061074--75061296
122
1.8
119
84
4
304
26
26
22
25
2.00
75065014--75065093
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
75072881--75072960
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
75072859--75072969
29
3.9
28
75
13
93
29
31
13
25
1.94
75080147--75080251
40
2.7
37
85
5
129
24
29
22
22
1.99
75086812--75086978
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
75086812--75086978
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
75087804--75087849
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
75094819--75094985
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318