Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  9  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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25
19
30
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
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1.99
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2.1
33
89
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3.2
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22
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138
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22
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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22
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25
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2398012--2398039
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0
0.76
2411235--2411460
73
3.1
73
81
3
292
29
17
20
31
1.96
2411377--2411716
89
3.9
89
86
6
470
27
17
20
35
1.95
2411377--2411716
170
2.0
172
89
6
526
27
17
20
35
1.95
2411555--2411798
76
3.2
75
83
10
307
27
15
22
34
1.95
2411838--2412029
72
2.6
72
91
1
294
28
16
22
32
1.96
2411653--2412162
199
2.6
196
86
5
670
28
16
21
32
1.95
2412228--2412403
71
2.5
71
86
3
237
28
15
25
30
1.96
2412295--2412652
126
2.8
126
95
1
644
29
17
20
32
1.95
2412426--2412997
201
2.8
203
75
18
542
31
16
19
33
1.93
2412547--2412830
72
3.9
72
91
3
426
31
16
20
31
1.95
2412857--2413159
54
5.6
54
96
0
552
31
14
17
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2416626--2416662
15
2.6
14
95
4
65
43
29
5
21
1.75
2416616--2416683
7
9.6
7
74
7
57
47
26
2
23
1.66
2416819--2416853
17
2.0
18
94
5
63
20
0
28
51
1.47
2416923--2417211
41
7.1
41
87
4
354
17
22
24
35
1.95
2421326--2421411
44
2.0
44
85
0
118
25
6
15
52
1.67
2422669--2422735
29
2.4
27
78
9
71
52
8
0
38
1.33
2423799--2423875
30
2.5
30
81
12
86
42
2
3
50
1.34
2427048--2427097
26
2.0
26
84
11
68
36
8
4
52
1.50
2432806--2432831
7
3.7
7
100
0
52
15
0
0
84
0.62
2441427--2441463
13
2.8
14
84
12
51
81
5
0
13
0.86
2448506--2448538
15
2.1
16
88
5
50
27
0
0
72
0.85
2449944--2449979
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
2466469--2466524
26
2.0
28
83
10
71
62
1
7
28
1.32
2468269--2468451
44
4.2
44
76
9
189
22
26
21
28
1.99
2468437--2469408
133
7.3
133
93
0
1453
26
23
21
28
1.99
2468799--2469402
43
13.7
44
64
18
164
26
24
21
28
1.99
2475246--2475297
18
2.8
19
72
16
54
50
9
7
32
1.64
2475368--2475425
23
2.5
23
100
0
116
46
43
3
6
1.47
2475854--2475889
16
2.4
16
86
13
51
41
11
0
47
1.39
2477231--2477286
9
6.2
9
83
6
60
12
14
0
73
1.11
2477258--2477282
13
1.9
13
100
0
50
16
12
0
72
1.13
2490975--2491006
15
2.1
15
94
0
55
28
6
6
59
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2491071--2491188
52
2.3
51
82
5
139
36
16
4
43
1.67
2501570--2501598
6
4.8
6
100
0
58
34
51
0
13
1.42
2510527--2510582
27
2.0
28
82
3
69
35
3
0
60
1.14
2511568--2511611
21
2.1
21
83
8
54
13
45
20
20
1.85
2512918--2512948
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
2514107--2514147
18
2.3
18
87
8
57
48
0
21
29
1.50
2516353--2516528
46
3.8
47
74
16
186
30
28
19
21
1.98
2518010--2518064
24
2.3
24
90
0
92
40
0
14
45
1.45
2518051--2518088
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
2521989--2522036
21
2.3
21
85
0
69
41
18
25
14
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318