Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  23  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5997554--5997922
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94
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347
23
28
20
27
1.99
6010851--6011209
141
2.6
138
79
10
372
23
28
20
27
1.99
6011536--6011592
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1.9
30
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133
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0
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20
25
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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4.5
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18
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1.97
6076757--6076896
54
2.6
55
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2
185
19
23
22
35
1.96
6076755--6076896
27
5.3
26
86
5
158
19
23
22
35
1.96
6080237--6080636
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130
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18
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2.0
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148
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105
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10
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7
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35
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0
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13
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14
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53
50
0
3
46
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3.8
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4
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15
12
30
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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1.99
6130259--6130426
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2.1
80
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196
26
26
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1.99
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25
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25
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0
0
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23
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27
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1.40
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20
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19
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41
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37
1.73
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2.0
42
81
4
100
28
25
28
17
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6224657--6224720
31
2.1
31
93
0
110
39
12
12
35
1.81
6225175--6225217
17
2.5
18
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11
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32
18
0
48
1.48
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255
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0
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14
16
26
1.86
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0
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10
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0
55
0
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14
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1.94
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2.4
28
90
0
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29
27
11
30
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2.1
18
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0
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10
10
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19
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0
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0
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63
96
0
236
44
17
11
26
1.82
6247109--6247195
29
3.0
29
94
0
156
35
18
16
29
1.92
6250184--6250258
38
2.0
38
81
5
89
50
13
8
28
1.69
6254487--6254529
18
2.4
18
84
7
52
37
20
9
32
1.85
6256201--6256249
24
2.0
25
84
4
64
6
22
2
69
1.21
6259571--6259605
18
2.0
18
88
5
54
74
2
0
22
0.95
6259876--6259924
23
2.2
24
85
10
68
69
0
20
10
1.17
6261441--6261472
15
2.1
16
94
5
57
28
31
21
18
1.97
6261686--6261728
23
1.9
23
90
4
70
44
16
6
32
1.74
6261686--6261738
23
2.4
22
83
3
61
43
16
7
32
1.76
6261910--6261982
23
3.2
23
69
11
60
23
8
21
46
1.78
6262450--6262502
25
2.2
25
93
3
90
41
11
7
39
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6264626--6264730
50
2.1
51
85
1
140
34
18
7
40
1.79
6264676--6264958
78
3.7
76
82
6
349
36
19
7
37
1.80
6264881--6264934
21
2.6
21
80
11
67
38
18
3
38
1.69
6277111--6277152
21
2.0
21
90
0
66
40
0
19
40
1.51
6277701--6277762
25
2.5
25
91
0
97
24
24
20
30
1.99
6279935--6279975
21
1.9
22
85
5
57
24
17
31
26
1.97
6283088--6283146
20
3.0
19
77
5
55
47
15
6
30
1.71
6286502--6286546
23
2.0
23
95
0
81
24
4
15
55
1.59
6288779--6288922
46
3.1
44
73
15
123
29
29
19
21
1.98
6298904--6298970
33
2.0
33
100
0
134
41
8
17
31
1.81
6299803--6299836
14
2.6
13
90
9
52
26
5
5
61
1.42
6302266--6302317
20
2.7
20
84
3
61
46
11
9
32
1.73
6302266--6302317
19
2.7
19
82
8
52
46
11
9
32
1.73
6304358--6304395
20
1.9
20
88
0
58
47
13
13
26
1.79
6304367--6304411
20
2.2
20
88
0
63
48
11
8
31
1.69
6314620--6314684
31
2.1
31
88
5
96
47
10
9
32
1.70
6315027--6315085
31
1.9
31
89
0
91
30
18
11
38
1.87
6321364--6321415
23
2.3
23
79
0
59
26
3
1
67
1.18
6323009--6323180
93
1.9
90
84
11
235
40
18
6
34
1.76
6323009--6323228
89
2.5
90
79
11
215
38
18
7
35
1.79
6323666--6323720
20
2.7
20
86
11
76
27
3
1
67
1.17
6323666--6323727
20
3.0
20
83
9
72
27
6
3
62
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6323757--6323808
19
2.7
20
78
3
61
28
5
3
61
1.37
6323973--6324250
95
3.1
90
82
10
309
35
7
17
38
1.79
6326264--6326326
26
2.5
24
80
16
74
36
0
4
58
1.19
6326368--6326417
21
2.4
22
83
16
70
30
4
0
66
1.10
6326377--6326416
18
2.2
18
90
0
62
27
5
0
67
1.11
6326368--6326407
9
4.4
9
83
0
53
27
2
0
70
1.01
6326516--6326588
31
2.5
30
76
24
75
34
2
1
61
1.19
6326691--6326741
19
2.8
17
82
14
57
35
5
1
56
1.35
6326933--6327016
26
3.1
27
78
13
68
29
5
4
59
1.42
6326954--6327013
28
2.1
28
85
11
79
30
6
3
60
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318