Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr02 99090824 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  28  of  318  ( 38146 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7515037--7515212
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
7520076--7520115
18
2.2
19
86
13
57
62
10
0
27
1.27
7521307--7521338
10
3.4
10
87
12
50
40
0
0
59
0.97
7529870--7529994
39
3.2
39
82
4
162
31
20
25
22
1.98
7529865--7530020
78
2.0
78
82
3
190
32
20
25
22
1.98
7530211--7530274
2
32.0
2
93
0
110
3
0
46
50
1.17
7537811--7537942
39
3.4
39
87
0
192
30
19
27
22
1.98
7537813--7537978
78
2.1
77
84
3
208
30
19
25
24
1.98
7553825--7553991
52
3.1
51
76
13
156
30
16
5
47
1.70
7553875--7553989
58
2.0
59
86
6
164
31
15
5
47
1.67
7555414--7556838
717
2.0
717
99
0
2841
38
10
13
37
1.79
7559890--7559940
26
1.9
27
84
4
68
41
3
3
50
1.39
7559901--7559951
27
1.9
26
88
4
75
43
1
1
52
1.23
7560093--7560131
19
2.1
18
85
4
51
46
2
0
51
1.14
7560321--7560352
4
8.0
4
100
0
64
25
0
0
75
0.81
7563458--7563497
20
2.0
20
95
0
71
27
32
5
35
1.79
7568254--7568280
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
7568624--7568720
41
2.3
41
84
5
124
31
24
18
24
1.97
7575259--7575300
9
4.7
9
87
0
66
33
11
42
11
1.78
7575461--7575580
11
10.8
11
77
0
105
5
6
29
59
1.44
7575468--7575580
22
5.2
22
82
1
120
5
6
29
59
1.44
7580242--7580331
45
2.0
46
95
2
164
24
2
40
33
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7582776--7582822
3
15.7
3
100
0
94
31
0
0
68
0.90
7583282--7583337
18
2.9
19
73
26
55
48
0
0
51
1.00
7583413--7583475
15
4.0
15
73
16
56
52
0
0
47
1.00
7588568--7588603
17
2.2
16
95
5
63
86
0
13
0
0.58
7600840--7601132
40
7.2
40
81
2
316
25
19
23
31
1.98
7600863--7601132
81
3.3
81
88
1
362
24
19
23
33
1.97
7601319--7601364
14
3.2
14
81
3
56
15
0
43
41
1.46
7601608--7601637
14
2.1
15
93
6
53
26
0
33
40
1.57
7601615--7601684
7
10.0
7
72
6
52
22
0
35
41
1.54
7609541--7609719
91
2.0
91
97
0
340
24
14
16
44
1.85
7611551--7611653
43
2.4
42
88
1
152
22
20
24
33
1.97
7614222--7614318
6
17.4
5
87
5
52
67
2
3
27
1.17
7614260--7614318
3
19.7
3
100
0
118
67
0
0
32
0.91
7614587--7614781
3
65.3
3
70
16
86
63
2
4
29
1.27
7614643--7614757
14
7.8
14
71
22
60
63
0
5
30
1.22
7614695--7614759
23
2.9
22
80
17
71
66
0
1
32
1.01
7614697--7614760
32
1.9
32
81
12
76
67
0
1
31
1.00
7615528--7615811
132
2.2
131
86
3
392
27
24
20
27
1.99
7615598--7615861
132
2.0
132
82
4
318
26
25
18
29
1.98
7615847--7616109
134
2.0
134
86
3
368
22
24
20
33
1.97
7615997--7616187
89
2.1
89
88
1
276
24
26
19
29
1.98
7615868--7616144
134
2.1
134
80
4
299
23
25
19
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7618614--7618782
47
3.6
47
95
0
284
37
13
22
26
1.91
7618761--7618957
54
3.6
54
81
7
229
35
17
24
22
1.95
7622524--7622557
17
2.0
17
100
0
68
70
5
11
11
1.32
7626718--7626867
3
50.3
3
66
16
55
63
2
4
30
1.26
7626763--7626852
23
3.8
23
72
15
76
62
1
4
32
1.22
7627285--7627327
13
3.4
13
77
6
52
6
0
51
41
1.29
7627833--7627873
17
2.3
19
80
16
52
29
0
4
65
1.13
7627842--7627878
17
2.2
17
90
9
58
29
0
2
67
1.04
7635479--7635510
8
4.1
8
92
8
57
75
0
12
12
1.06
7635479--7635509
15
2.1
15
100
0
62
74
0
12
12
1.08
7636400--7636484
40
2.2
37
79
10
89
12
16
12
57
1.65
7641608--7641638
15
2.1
15
93
0
53
38
12
25
22
1.90
7646977--7647022
18
2.5
19
86
10
60
76
8
8
6
1.17
7647267--7647863
146
4.1
146
89
2
889
55
6
9
29
1.56
7647100--7647865
291
2.7
292
91
4
1247
55
6
8
30
1.54
7647960--7648007
18
2.6
18
86
6
60
4
6
10
79
1.05
7652432--7652480
23
2.2
23
80
16
59
73
6
14
6
1.22
7652926--7653045
61
2.0
61
91
0
195
52
10
2
35
1.48
7655069--7655122
21
2.6
22
80
11
60
25
31
29
12
1.93
7666096--7666152
26
2.1
28
93
6
100
24
22
3
49
1.66
7666039--7666156
20
5.6
20
65
23
53
16
18
7
56
1.63
7668585--7668633
23
2.2
22
92
3
80
24
0
6
69
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7668578--7668646
29
2.4
29
77
15
72
30
0
7
62
1.22
7669468--7669521
21
2.5
21
81
3
63
70
0
0
29
0.88
7671723--7671808
43
2.0
43
86
0
118
25
18
30
25
1.98
7691662--7691726
21
3.2
21
74
12
73
41
21
26
10
1.86
7691656--7691744
39
2.3
39
96
0
160
39
23
25
11
1.88
7691679--7691744
18
3.5
18
76
11
78
37
24
28
9
1.86
7699579--7699643
21
3.2
21
74
12
73
43
21
26
9
1.82
7699573--7699661
39
2.3
39
96
0
160
41
23
24
10
1.85
7704335--7704369
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
7723052--7723076
6
4.2
6
100
0
50
16
0
0
84
0.63
7726674--7726711
20
1.9
20
100
0
76
34
18
10
36
1.85
7732842--7732866
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
7735015--7735043
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
7741034--7741100
30
2.2
30
97
0
125
34
5
4
55
1.45
7744246--7744271
5
5.2
5
100
0
52
19
19
19
42
1.90
7745351--7745509
43
3.7
42
72
10
135
25
18
26
30
1.98
7747869--7747974
46
2.3
46
88
4
151
33
26
18
21
1.97
7756499--7756550
21
2.4
21
75
15
52
69
7
0
23
1.14
7756701--7756759
3
19.0
3
74
19
50
61
3
1
33
1.23
7756701--7756759
7
9.5
6
72
20
50
61
3
1
33
1.23
7756681--7756787
36
3.2
34
75
12
98
59
1
3
34
1.26
7756681--7756787
16
6.4
16
73
18
76
59
1
3
34
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7758345--7758934
119
5.0
119
94
1
999
30
18
17
33
1.94
7781050--7781074
12
2.1
12
100
0
50
68
0
0
32
0.90
7783726--7783768
14
2.9
14
83
13
50
27
0
6
65
1.18
7784523--7784551
15
1.9
15
100
0
58
31
0
0
68
0.89
7787597--7787641
2
23.0
2
95
4
83
0
48
0
51
1.00
7800902--7801009
26
4.2
26
91
0
180
33
7
23
36
1.83
7802487--7802539
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
7806708--7806743
18
2.1
18
89
5
56
33
25
0
41
1.55
7811543--7811586
6
7.5
6
89
5
63
79
4
0
15
0.89
7811543--7811591
11
4.3
11
84
7
62
79
4
2
14
0.97
7811543--7811586
18
2.5
17
88
3
70
79
4
0
15
0.89
7815779--7815839
3
20.3
3
77
15
56
68
0
3
27
1.05
7815782--7815878
8
11.9
8
81
14
74
67
1
2
29
1.09
7820252--7820459
18
11.5
18
80
1
202
34
12
12
39
1.82
7820252--7820459
54
3.8
54
87
1
256
34
12
12
39
1.82
7820566--7820597
6
5.3
6
92
0
55
46
15
15
21
1.83
7821111--7821144
2
17.0
2
100
0
68
50
50
0
0
1.00
7821888--7821921
17
2.1
15
89
10
50
0
35
0
64
0.94
7821985--7822028
2
22.0
2
100
0
88
50
0
0
50
1.00
7822481--7822537
23
2.4
24
88
5
89
38
19
5
36
1.74
7822829--7822874
3
15.7
3
95
4
85
65
0
0
34
0.93
7832722--7832750
3
9.7
3
100
0
58
34
34
31
0
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7839028--7839077
25
2.0
25
84
7
66
40
4
0
56
1.18
7840634--7840673
20
1.9
21
85
10
55
45
20
5
30
1.72
7851360--7851430
35
2.0
35
88
0
106
30
25
7
36
1.83
7854043--7854103
32
1.9
32
86
6
88
52
6
0
40
1.27
7855366--7855416
19
2.6
19
76
14
59
50
5
17
25
1.68
7868836--7868945
2
60.5
2
67
18
62
0
49
0
50
1.00
7868833--7868934
25
3.8
26
72
15
84
0
50
0
49
1.00
7868839--7868975
39
3.5
39
75
13
138
1
47
0
51
1.09
7868847--7869027
51
3.5
51
77
9
161
2
45
0
50
1.20
7868833--7868987
78
2.0
75
82
6
186
1
47
0
50
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318