Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  49  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13724136--13724184
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4.2
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21
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25
1.99
13732131--13732179
17
2.8
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22
50
24
18
22
34
1.96
13733001--13733167
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
13735183--13735231
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
13736052--13736218
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
13743182--13743230
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
13744052--13744217
40
4.2
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26
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2.00
13763022--13763240
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2.7
80
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2.2
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0
0
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18
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13783708--13783758
21
2.4
21
78
18
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41
17
23
17
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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18
19
1.84
13783691--13783850
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20
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64
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26
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20
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27
4.5
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22
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2.4
54
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2.2
26
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2.7
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23
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3.4
16
68
21
54
18
12
0
70
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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13847243--13847301
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2.1
28
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13
0
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21
11
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2.8
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322
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23
27
25
2.00
13855129--13855346
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23
27
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119
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23
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25
2.00
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3.5
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15
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23
21
11
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13862308--13862528
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90
4
322
24
23
27
25
2.00
13862311--13862528
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307
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23
27
25
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13862311--13862528
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1.8
119
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318
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23
27
25
2.00
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920
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1.95
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20
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1.96
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19
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85
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18
22
26
1.97
13889907--13889958
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2.2
24
89
0
77
36
3
9
50
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13902657--13902684
10
2.8
10
100
0
56
53
17
0
28
1.44
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0
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50
10
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21
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1.71
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1587
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12
23
34
1.91
13930685--13930725
21
1.9
22
85
5
57
17
4
24
53
1.63
13933191--13933242
24
2.2
24
89
0
77
36
3
9
50
1.54
13933597--13933625
14
2.1
14
100
0
58
41
6
6
44
1.58
13933725--13933782
8
6.9
8
75
11
53
31
0
3
65
1.09
13933725--13933775
25
2.1
24
85
10
68
31
0
3
64
1.11
13933724--13933782
17
3.5
16
77
9
64
32
0
3
64
1.10
13938187--13938336
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
13938211--13938394
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
13948403--13948486
43
2.0
43
90
0
132
22
19
30
27
1.98
13951229--13951388
29
5.4
29
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3
248
36
13
23
25
1.92
13951229--13951388
59
2.7
58
92
2
248
36
13
23
25
1.92
13959586--13959671
43
2.0
43
88
0
127
26
20
25
26
1.99
13968061--13968231
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
13977502--13977623
47
2.6
44
80
13
131
27
18
30
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13981988--13982089
29
3.5
28
76
7
89
27
34
17
20
1.95
13989476--13989514
13
3.0
13
96
0
69
15
33
30
20
1.94
13994677--13994815
58
2.4
58
81
11
169
42
0
3
53
1.23
13995099--13995201
34
3.0
34
100
0
206
34
8
17
38
1.81
13997880--13997931
15
3.2
15
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50
46
0
0
53
1.00
13997893--13997929
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1.9
19
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0
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0
0
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1.00
13998012--13998067
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2.6
22
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5
62
51
0
0
48
1.00
14000000--14000064
20
3.4
19
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43
1
10
44
1.48
14000500--14000545
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2.0
23
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0
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10
10
2
76
1.12
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2.0
20
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0
55
58
2
4
34
1.32
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15
3.6
15
70
14
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50
9
9
30
1.66
14003463--14003510
20
2.4
20
79
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53
39
6
14
39
1.71
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29
1.9
29
92
0
94
60
3
1
33
1.24
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1.9
31
85
0
82
35
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11
40
1.79
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1.9
19
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0
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2
13
32
1.55
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109
6.1
107
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4
810
39
15
12
32
1.85
14009176--14009833
220
3.1
216
85
4
852
39
15
12
32
1.85
14016159--14016188
14
2.1
14
100
0
60
20
6
16
56
1.62
14020373--14020404
9
3.6
9
95
0
55
59
0
6
34
1.23
14029332--14029371
21
2.0
20
85
5
53
57
5
0
37
1.21
14029593--14029645
19
2.8
19
82
0
70
30
11
5
52
1.60
14030772--14030813
13
2.9
14
82
13
50
42
0
2
54
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14030824--14030871
25
1.9
24
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52
0
0
47
1.00
14030851--14030952
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2.7
37
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48
0
3
48
1.20
14030957--14030981
6
4.2
6
100
0
50
80
0
0
20
0.72
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14
2.5
13
86
9
50
47
0
8
44
1.34
14033570--14033819
40
6.2
40
90
1
376
22
28
23
25
1.99
14041745--14041990
40
6.2
40
87
5
349
21
28
23
25
1.99
14041745--14041990
116
2.1
117
87
4
343
21
28
23
25
1.99
14044763--14044909
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2.0
75
94
0
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2.0
82
98
0
323
28
21
11
39
1.88
14050454--14050491
19
2.0
19
100
0
76
31
10
10
47
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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