Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  281  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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2.0
23
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26
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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201
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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17
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1
26
46
1.61
89180133--89180183
15
3.5
15
86
2
68
23
1
27
47
1.63
89180117--89180179
14
4.4
14
80
4
72
23
1
26
47
1.61
89181172--89181301
66
2.0
66
84
0
170
46
26
0
26
1.58
89181262--89181356
22
4.4
22
69
18
65
45
29
1
24
1.60
89181660--89181751
7
12.7
7
76
15
80
75
3
0
21
0.95
89181678--89181762
8
11.2
8
85
6
81
72
1
0
25
0.91
89183145--89183194
16
3.3
16
67
16
52
28
18
10
44
1.81
89183139--89183203
29
2.2
28
84
7
94
24
20
12
43
1.86
89185608--89185689
25
3.4
24
72
11
78
25
3
4
65
1.29
89185815--89186051
43
5.5
43
91
3
350
23
20
31
24
1.98
89185815--89186051
88
2.7
86
88
3
352
23
20
31
24
1.98
89190225--89190360
59
2.3
57
83
6
166
44
0
2
52
1.16
89191225--89191253
14
2.0
15
93
6
51
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89191435--89191486
16
3.2
16
88
0
77
28
23
5
42
1.77
89196463--89196513
19
2.6
20
78
12
61
39
1
7
50
1.42
89196452--89196519
19
3.6
18
71
9
55
35
1
7
55
1.37
89200995--89201020
12
2.2
12
100
0
52
26
23
0
50
1.50
89209017--89209163
63
2.3
63
83
2
179
34
31
8
25
1.85
89210100--89210139
20
2.0
20
85
9
55
25
0
5
70
1.08
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29
2.4
30
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4
85
41
4
13
41
1.64
89211627--89211657
16
1.9
16
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0
53
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12
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29
1.85
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21
2.0
21
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0
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29
21
29
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1.98
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16
1.9
16
93
0
53
41
12
16
29
1.85
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
89221181--89221211
16
1.9
16
93
0
53
41
12
16
29
1.85
89223822--89223877
28
2.0
28
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6
87
37
16
7
39
1.76
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31
2.0
31
90
3
97
36
14
8
40
1.76
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2.8
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100
0
50
44
0
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0
0.99
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44
2.0
44
100
0
176
34
2
9
54
1.44
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44
2.0
43
89
4
133
32
3
9
54
1.49
89238592--89238616
13
1.9
13
100
0
50
68
0
8
24
1.16
89238992--89239037
24
1.9
24
86
8
67
45
15
13
26
1.82
89239132--89239200
20
3.6
19
79
11
70
56
0
7
36
1.27
89239136--89239200
3
22.3
3
75
12
55
56
0
7
35
1.28
89240595--89240707
42
2.6
43
79
5
122
20
25
19
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89240596--89240879
86
3.3
85
89
3
358
19
23
21
34
1.96
89240695--89240837
44
3.3
44
71
14
161
18
23
22
35
1.95
89240594--89240923
44
7.7
43
69
12
153
20
23
20
35
1.96
89240739--89240923
42
4.3
42
72
11
133
22
21
21
34
1.97
89252133--89252166
16
2.1
16
100
0
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52
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17
17
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1.9
13
100
0
50
68
0
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20
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19
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56
0
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36
1.27
89253833--89253897
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56
0
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28
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0
101
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18
0
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1.50
89255361--89255409
15
3.4
15
71
21
50
42
16
0
40
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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