Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  11  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2800339--2800371
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2.3
15
90
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2800518--2800552
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2.5
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90
0
52
20
14
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1.54
2801237--2801294
22
2.5
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2801760--2801812
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25
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2.1
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1.30
2802471--2802508
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1.9
19
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2.0
22
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2
0
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1.09
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19
2.4
18
80
19
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28
4
0
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1.10
2815437--2815478
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2.6
16
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10
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28
4
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1.12
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1.9
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2
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34
21
23
20
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20
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1.8
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36
21
23
19
1.95
2833034--2833183
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3.5
41
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115
34
20
23
21
1.97
2833027--2833318
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3.4
86
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2
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37
20
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19
1.95
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19
2.4
18
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19
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1.10
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16
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28
4
0
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1.12
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23
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2
2
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1.26
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23
6.6
23
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20
19
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1.8
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1
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21
18
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30
2.1
30
93
0
108
58
9
4
26
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2850015--2850045
2
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2
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0
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0
0
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1.00
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20
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14
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4
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2852592--2852620
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0
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0
0
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2.2
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2
135
51
4
3
40
1.39
2856511--2856541
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0
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0
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13
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2
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21
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50
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2
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11
2.6
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53
0
0
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1.00
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43
9
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21
2.0
23
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20.0
3
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77
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5
1
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2892358--2892425
26
2.7
26
79
6
68
27
2
5
63
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
21
81
15
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34
6
2
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1.34
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17
3.1
17
73
21
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72
5
0
22
1.05
2899209--2899270
19
3.4
19
74
17
69
70
4
0
24
1.06
2899221--2899277
19
3.3
17
72
18
55
75
3
1
19
1.04
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2
100
0
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0
0
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1.00
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19
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0
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1.21
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62
0
7
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22
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59
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16
19
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1.91
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2.0
31
93
0
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3.1
122
81
4
436
31
14
19
33
1.92
2925482--2925837
126
2.9
126
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3
418
32
14
19
33
1.92
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30
2.0
30
93
0
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11
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2.8
18
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8
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36
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0
62
1.07
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19
2.8
18
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5
50
50
3
0
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1.20
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27
73
3
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53
3
0
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22
2.0
22
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13
4
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1.60
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0
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19
18
26
1.95
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129
3.5
129
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414
35
19
18
27
1.95
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15
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36
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6
1.54
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13
4.4
13
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18
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39
50
0
9
1.35
2948151--2948197
22
2.1
22
96
0
85
36
53
0
10
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2948592--2948633
19
2.3
18
87
4
57
26
2
2
69
1.13
2948618--2948699
33
2.3
39
83
12
104
34
13
0
52
1.41
2948645--2948729
23
3.6
23
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1.39
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5.2
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18
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1.98
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2.6
412
94
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1894
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18
22
28
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2.2
45
85
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142
30
15
28
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16
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42
44
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1.55
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2.4
39
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11
105
34
13
0
51
1.42
2960999--2961083
23
3.6
23
70
9
64
29
9
2
58
1.42
2963253--2963347
35
2.7
35
96
0
172
28
9
26
35
1.88
2963251--2963417
35
4.6
36
79
14
161
31
10
23
34
1.89
2963253--2963422
74
2.4
74
82
12
203
31
11
22
34
1.89
2968216--2968285
31
2.3
31
79
0
77
51
14
8
25
1.70
2969867--2969913
19
2.6
18
80
6
67
36
0
0
63
0.94
2970343--2970385
22
2.0
22
85
0
59
69
18
4
6
1.29
2975452--2975479
9
3.1
9
100
0
56
32
21
0
46
1.52
2978383--2978420
7
5.4
7
100
0
76
28
0
13
57
1.36
2979310--2979370
21
3.0
20
79
13
70
39
44
9
6
1.64
2985206--2985472
125
2.1
125
92
2
437
29
16
17
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2986983--2987025
10
4.3
10
77
11
52
55
4
0
39
1.20
2990771--2990810
20
2.0
20
90
4
64
30
0
2
67
1.04
2991138--2991170
15
2.2
15
89
10
50
51
6
12
30
1.63
2991261--2991306
19
2.6
18
83
13
60
67
0
6
26
1.15
2991794--2991875
31
2.7
30
81
5
94
51
7
6
35
1.55
3000766--3000805
1
40.0
1
84
0
53
0
7
0
92
0.38
3000766--3000810
6
7.5
6
90
7
56
0
8
2
88
0.58
3000766--3000810
12
3.8
12
88
8
65
0
8
2
88
0.58
3001366--3001390
12
2.1
12
100
0
50
24
24
24
28
2.00
3008115--3008149
10
3.6
10
92
3
54
77
5
0
17
0.96
3008096--3008152
8
6.8
8
78
11
51
77
3
0
19
0.92
3010822--3010999
46
3.8
46
76
12
202
20
20
29
30
1.97
3010818--3010991
93
1.9
93
92
0
294
20
20
29
29
1.97
3017750--3017800
24
2.1
24
89
7
77
17
21
23
37
1.94
3019616--3019712
30
3.2
30
69
11
79
34
10
17
38
1.84
3019800--3019851
2
27.0
2
80
7
54
51
7
0
40
1.30
3020369--3020404
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00
3020371--3020415
11
4.1
11
88
5
56
42
0
57
0
0.98
3020676--3020711
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
3020675--3020712
15
2.5
16
87
12
62
15
5
13
65
1.43
3021151--3021256
35
3.0
35
94
0
185
22
13
49
15
1.79
3021965--3022112
48
2.9
50
80
12
176
35
18
16
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3022168--3022685
70
7.2
70
91
6
840
31
20
15
32
1.94
3022168--3022685
147
3.6
147
96
2
926
31
20
15
32
1.94
3027201--3027351
53
2.8
53
88
4
205
30
27
15
25
1.96
3040479--3040517
2
19.5
2
89
0
60
48
2
2
46
1.29
3040681--3040735
2
29.0
2
78
10
53
52
7
0
40
1.29
3040681--3040732
22
2.3
23
90
6
88
53
7
0
38
1.30
3041248--3041284
11
3.2
12
88
11
60
45
0
54
0
1.00
3041246--3041295
11
4.5
11
82
9
57
44
0
56
0
0.99
3041558--3041593
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
3041557--3041595
15
2.6
16
84
16
64
15
5
15
64
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318