Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  308  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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188
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30
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134
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5
2
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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32
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1.40
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140
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16
20
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
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15
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
9
37
1.34
96233602--96233639
18
2.1
18
100
0
76
39
21
21
18
1.93
96233602--96233633
10
3.4
10
83
16
50
40
21
18
18
1.91
96234534--96234562
4
7.2
4
100
0
58
0
24
0
75
0.80
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47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
96242694--96242747
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
96242720--96242818
52
2.0
49
82
13
121
54
3
10
32
1.49
96242946--96243000
17
3.4
16
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14
60
65
0
7
27
1.19
96242948--96242985
20
1.9
20
94
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67
68
0
5
26
1.11
96242956--96243000
15
2.9
15
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66
0
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1.16
96242948--96243033
15
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14
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65
0
8
26
1.21
96250351--96250416
31
2.1
31
91
0
105
36
12
10
40
1.77
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2
16.5
2
93
6
57
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
29
100
0
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48
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10
27
1.75
96263130--96263190
29
2.1
29
93
0
104
32
14
11
40
1.82
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2
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2
95
4
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50
0
0
50
1.00
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13
2.5
13
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4
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70
2
0
26
1.01
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12
5.8
12
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20
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13
2
0
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0.75
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20
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6
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13
3
0
83
0.79
96287325--96287396
29
2.4
29
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13
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12
4
0
83
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18
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1.04
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17
0
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13
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17
0
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0.92
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1
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23
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0
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0
0
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3.5
24
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15
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0
1
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33
0
1
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1.03
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3.1
21
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0
1
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22
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39
0
1
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1.08
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21
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22
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1
1
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1.18
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24
2.5
24
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3
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18
1.14
96292532--96292578
18
2.6
18
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74
2
10
12
1.16
96292532--96292579
19
2.6
18
83
3
60
75
2
10
12
1.14
96293156--96293191
18
2.0
18
100
0
72
55
5
5
33
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96294323--96294430
56
1.9
56
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1
146
49
2
7
40
1.45
96297423--96297451
14
2.1
14
93
6
51
51
0
0
48
1.00
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10
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56
12
2
30
1.47
96301600--96301668
20
3.4
20
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53
11
1
33
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19
3.5
19
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4
84
53
10
1
34
1.44
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19
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2.3
24
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0
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98
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2
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4.8
16
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77
17
2
0
79
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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