Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  231  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72720412--72720522
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.91
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22
1.91
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2.7
18
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69
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28
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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25
1.14
72853110--72853298
3
63.3
3
65
13
50
56
3
8
31
1.48
72853250--72853300
25
2.0
25
92
7
84
52
0
9
37
1.34
72853298--72853329
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
72853432--72853474
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
72853569--72853601
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
72853695--72853735
3
13.7
3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
72854192--72854271
30
2.6
30
88
7
117
55
16
5
23
1.61
72854192--72854271
31
2.6
31
92
5
128
55
16
5
23
1.61
72854464--72854497
14
2.5
14
90
4
52
2
2
2
91
0.57
72854464--72854498
13
2.7
13
90
0
52
2
2
5
88
0.68
72854801--72855385
205
2.9
204
92
1
895
29
22
18
29
1.97
72863382--72863431
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
72866452--72866501
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72870295--72870355
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
72870447--72870578
3
43.7
3
73
13
83
56
1
7
34
1.37
72870578--72870609
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
72870713--72870755
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
72870851--72870883
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
72870976--72871019
3
14.7
3
100
0
88
65
0
0
34
0.93
72872287--72872331
21
2.2
21
84
4
56
22
24
24
28
1.99
72872299--72872357
21
2.9
21
89
2
84
25
27
20
27
1.99
72873925--72873999
29
2.6
29
80
2
87
21
33
17
28
1.96
72876430--72876459
2
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2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
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19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
72894358--72894568
95
2.2
96
88
2
300
30
27
18
23
1.98
72894358--72894581
48
4.7
48
86
3
283
30
26
18
24
1.98
72897359--72897392
10
3.3
11
88
12
54
47
23
0
29
1.52
72899595--72899621
13
2.1
13
100
0
54
37
11
22
29
1.89
72901736--72902287
87
6.3
87
80
9
491
36
18
17
27
1.93
72902109--72902143
13
2.6
14
90
4
54
54
5
14
25
1.62
72901802--72902287
176
2.8
176
82
8
535
35
18
17
27
1.94
72901810--72902309
89
5.7
86
79
9
390
36
18
17
28
1.93
72902214--72902820
75
8.3
73
84
7
723
33
19
16
30
1.94
72902214--72902820
148
4.1
145
87
4
751
33
19
16
30
1.94
72902818--72903171
99
3.7
97
82
11
405
37
19
18
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72903009--72903173
89
1.9
85
86
5
231
35
20
18
25
1.95
72907606--72907648
22
2.0
22
100
0
86
46
11
4
37
1.61
72911729--72911763
16
2.3
15
90
5
52
31
2
2
62
1.24
72917006--72917046
2
20.0
2
90
5
64
46
2
2
48
1.28
72920995--72921092
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
72925141--72925201
25
2.4
25
78
8
61
32
18
22
26
1.97
72925157--72925222
25
2.6
26
85
7
91
31
18
24
25
1.97
72926987--72927099
27
4.2
28
70
18
87
28
15
28
27
1.96
72927055--72927234
27
6.7
27
69
7
96
32
18
25
23
1.97
72927065--72927203
54
2.6
54
71
7
120
33
17
24
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318