Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  232  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72927661--72927711
3
16.0
3
88
11
75
33
0
3
62
1.13
72927960--72928023
31
2.0
32
85
8
87
45
0
7
46
1.32
72927820--72928113
142
2.1
140
81
8
328
45
2
10
41
1.51
72928931--72928987
15
3.9
15
93
2
98
33
0
12
54
1.38
72932754--72932832
30
2.6
29
75
15
79
65
1
8
24
1.28
72933597--72933643
23
2.0
23
100
0
94
42
12
21
23
1.87
72933944--72933975
6
5.7
6
92
7
50
15
0
0
84
0.63
72935614--72935712
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
72943294--72943392
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
72948953--72948978
12
2.2
12
100
0
52
15
0
0
84
0.62
72948946--72948978
17
1.9
17
100
0
66
15
0
0
84
0.61
72949061--72949102
13
3.5
13
81
18
63
50
14
0
35
1.43
72949061--72949104
23
1.9
23
100
0
88
50
13
0
36
1.42
72949062--72949111
23
2.2
23
92
0
82
52
14
0
34
1.42
72950779--72950835
30
1.9
30
82
13
73
45
10
8
35
1.70
72957643--72957672
12
2.4
13
94
5
53
70
0
0
30
0.88
72958201--72958248
22
2.2
21
85
10
62
20
2
8
68
1.26
72969628--72969717
42
2.1
43
81
6
103
31
20
21
27
1.98
72974303--72974339
18
2.1
18
89
0
56
81
5
13
0
0.86
72975455--72975555
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
72975484--72975559
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
72980162--72980186
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72981018--72981240
47
4.8
44
77
11
155
28
20
29
21
1.98
72995716--72995747
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
72997311--72997443
40
3.3
40
88
5
162
27
27
19
25
1.99
72997339--72997496
40
4.0
40
87
4
196
25
25
22
26
2.00
73002473--73003192
48
15.0
48
91
0
1152
35
6
25
31
1.82
73003237--73003381
37
3.9
37
90
0
209
25
19
31
23
1.98
73004601--73004790
40
4.8
40
91
0
281
26
20
26
25
1.99
73008285--73008604
48
6.6
48
91
0
514
35
5
26
32
1.80
73009970--73010137
40
4.2
40
79
1
158
22
27
23
26
2.00
73009986--73010135
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
73017936--73018103
40
4.2
40
80
1
167
23
27
23
26
2.00
73017936--73018103
80
2.1
80
84
6
216
23
27
23
26
2.00
73019771--73020272
48
10.5
48
90
0
781
36
6
25
31
1.81
73020317--73020460
37
3.9
37
91
1
236
24
19
32
23
1.97
73020317--73020460
73
2.0
74
91
1
236
24
19
32
23
1.97
73022972--73023061
39
2.3
39
92
3
146
27
22
26
23
1.99
73024295--73024406
59
1.9
57
82
10
138
37
17
16
28
1.91
73025602--73025768
40
4.2
40
80
3
176
25
22
27
24
2.00
73025602--73025752
80
1.9
79
84
4
205
25
22
27
23
2.00
73029595--73029649
22
2.5
22
93
0
101
18
12
29
40
1.87
73029617--73029760
38
3.8
38
82
1
164
19
15
24
40
1.90
73037041--73037121
39
2.1
39
83
0
99
33
35
18
12
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73038847--73038895
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
73039715--73039865
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
23
2.00
73039751--73039881
40
3.3
40
79
4
149
24
22
26
25
2.00
73046812--73046860
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
73047674--73047824
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
23
2.00
73047710--73047840
40
3.3
40
79
4
149
24
22
26
25
2.00
73050774--73050939
46
3.6
44
84
8
181
22
26
21
28
1.99
73059680--73059822
48
3.0
48
88
0
223
20
18
30
31
1.96
73063425--73063485
30
2.0
30
87
0
86
29
24
8
37
1.84
73067174--73067243
25
2.8
25
84
0
86
25
21
25
27
1.99
73068036--73068131
27
3.6
27
85
12
87
25
26
18
30
1.98
73068051--73068134
27
3.1
27
86
3
116
22
27
19
30
1.98
73068196--73068496
27
11.1
27
75
6
189
31
8
18
40
1.81
73068201--73068308
56
1.9
57
83
5
139
34
6
16
42
1.74
73068286--73068491
80
2.6
80
81
2
207
29
8
20
41
1.82
73068173--73068503
54
6.1
54
73
6
238
31
9
19
39
1.83
73068442--73068505
27
2.4
27
79
10
85
31
4
23
40
1.75
73068484--73068721
27
8.8
27
90
0
323
39
9
23
28
1.85
73068482--73068721
81
3.0
81
90
0
372
39
9
22
28
1.85
73074433--73074481
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
73075303--73075451
39
3.8
39
81
9
162
28
22
25
24
1.99
73075301--73075468
40
4.3
39
77
11
157
27
21
26
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73082370--73082418
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
73083228--73083329
40
2.5
40
84
3
125
30
22
24
22
1.99
73083270--73083377
38
2.8
38
82
12
130
28
23
27
20
1.99
73083267--73083392
38
3.3
36
80
12
128
27
22
27
22
1.99
73087420--73087502
29
2.9
29
96
0
157
30
13
28
27
1.94
73093481--73093560
29
2.8
29
94
0
142
32
13
26
27
1.94
73095367--73095429
24
2.6
24
92
0
99
20
1
7
69
1.22
73095389--73095435
6
7.8
6
80
17
53
25
0
4
70
1.05
73101250--73101321
35
2.1
35
94
0
126
37
6
20
34
1.80
73113189--73113221
14
2.4
14
85
5
50
60
0
6
33
1.21
73120743--73120799
15
3.5
15
73
17
51
66
0
0
33
0.92
73120741--73120806
26
2.4
29
83
14
79
65
0
0
34
0.93
73121352--73121389
14
2.7
14
95
0
67
39
7
18
34
1.80
73121935--73121976
15
2.9
15
79
6
52
42
0
2
54
1.13
73121980--73122039
22
2.8
22
85
5
70
51
0
0
48
1.00
73124501--73124616
43
2.7
43
83
1
144
21
19
27
31
1.98
73128036--73128088
15
3.5
15
79
5
63
11
13
15
60
1.59
73128586--73128618
18
1.9
17
88
11
50
57
6
18
18
1.60
73129824--73130197
38
8.8
40
70
19
224
30
14
24
31
1.95
73129861--73130157
47
6.7
46
73
17
270
30
14
23
31
1.94
73129904--73130195
85
3.4
85
93
0
512
29
14
24
31
1.95
73133520--73133668
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73133561--73133668
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
73139453--73139504
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
73139555--73139614
27
2.3
26
82
2
66
23
21
20
35
1.96
73146616--73146667
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
73146700--73146731
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
73154473--73154502
14
2.1
15
93
6
53
63
13
10
13
1.52
73162142--73162251
40
2.7
40
79
10
118
23
27
23
25
2.00
73164744--73165008
27
9.8
27
90
0
377
29
24
7
38
1.83
73164699--73165207
27
18.9
27
79
6
144
33
22
8
34
1.85
73165001--73165178
54
3.3
54
80
4
189
39
21
8
29
1.84
73165001--73165178
81
2.2
81
83
6
218
39
21
8
29
1.84
73173914--73174080
40
4.2
40
93
0
271
27
29
19
22
1.98
73194293--73194321
8
3.6
8
100
0
58
34
0
0
65
0.93
73194897--73194985
38
2.4
38
83
5
101
43
4
5
46
1.47
73195301--73195334
17
2.1
17
88
5
52
17
5
0
76
0.98
73198236--73198311
37
2.1
37
100
0
152
38
10
28
22
1.87
73198591--73198889
145
2.0
147
90
2
478
33
12
21
32
1.91
73204656--73204763
38
2.8
38
85
0
153
10
22
30
37
1.87
73205223--73205263
21
2.0
21
85
9
57
31
4
19
43
1.72
73208509--73208546
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
73212322--73212360
20
2.0
20
89
0
60
28
0
0
71
0.86
73217960--73217999
21
1.9
21
84
0
53
47
5
12
35
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73219893--73219941
25
2.0
25
83
0
62
40
16
8
34
1.78
73231022--73231068
19
2.5
19
89
0
67
40
2
17
40
1.61
73244216--73244348
40
3.3
40
91
3
207
24
24
27
24
2.00
73247566--73247651
40
2.2
40
100
0
172
51
22
0
26
1.48
73250185--73250256
37
1.9
37
91
0
117
27
29
19
23
1.98
73250402--73250591
98
1.9
97
90
6
303
30
25
7
36
1.85
73250402--73250586
48
3.8
48
90
4
291
30
25
7
36
1.84
73250556--73250749
47
4.1
47
89
0
280
26
29
11
32
1.91
73250509--73250749
94
2.6
94
84
4
281
27
29
10
33
1.90
73250649--73250720
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318