Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  127  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3.3
20
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1
20
4
74
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
15
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29
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28
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1.66
38995478--38995521
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3.1
14
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27
0
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15
26
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30
3.2
30
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5.5
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77
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1.00
39011675--39011742
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1.04
39011686--39011742
5
11.0
5
77
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55
77
1
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3
1.00
39011686--39011742
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1.00
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2.6
12
100
0
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45
12
16
25
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.27
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3.3
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51
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16
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2.1
29
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0
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1.54
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21
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4.1
53
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200
31
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20
40
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39044990--39045207
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199
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1.81
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1.81
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38
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32
1.82
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1.81
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1.97
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0
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38
19
6
35
1.77
39074167--39074206
11
3.8
10
83
9
53
15
2
7
75
1.14
39074160--39074207
21
2.4
19
86
10
69
14
2
6
77
1.06
39075910--39076008
30
3.3
31
73
6
98
28
15
30
26
1.96
39076716--39076812
30
3.2
30
71
8
81
29
26
14
28
1.95
39079376--39079432
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
39079376--39079432
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
39079376--39079432
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
39079480--39079510
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
39079513--39079537
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
39079507--39079562
18
3.1
18
79
5
60
69
1
19
8
1.24
39079513--39079594
30
2.7
31
84
5
114
64
0
21
13
1.28
39081804--39081901
30
3.3
30
72
4
90
27
26
16
29
1.97
39086589--39086685
30
3.2
30
77
2
106
27
26
16
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39089256--39089326
37
1.9
37
86
11
101
76
2
18
2
1.04
39089266--39089315
6
8.2
6
83
14
50
76
2
20
2
0.99
39089397--39089421
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
39089391--39089446
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
39089397--39089478
30
2.7
31
81
5
105
64
1
21
12
1.33
39091566--39091662
30
3.2
30
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2
106
27
26
16
28
1.97
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46
3.0
44
80
7
122
25
23
26
24
2.00
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38
2.8
38
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1
189
23
22
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39
1.91
39098577--39098678
31
3.1
31
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132
23
21
15
39
1.92
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24
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9
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26
24
21
27
1.99
39098862--39098980
47
2.5
48
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8
163
26
24
21
28
1.99
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20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
39099133--39099180
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
39101280--39101327
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
39101274--39101317
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
39101274--39101333
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
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1.56
39102306--39102350
14
3.3
14
84
6
65
48
13
0
37
1.42
39102362--39102431
22
3.3
22
64
22
58
40
14
11
34
1.82
39102332--39102438
42
2.5
42
96
1
196
42
13
12
32
1.81
39102343--39102409
20
3.2
20
66
22
57
41
8
14
34
1.78
39104872--39104921
18
2.8
18
87
0
73
14
28
0
58
1.37
39104847--39104924
24
3.2
24
79
0
93
12
28
0
58
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39107277--39107303
10
2.7
10
100
0
54
18
11
29
40
1.85
39107582--39107611
11
2.7
11
94
0
51
13
3
3
80
0.97
39107580--39107616
13
3.0
13
80
15
51
16
2
5
75
1.10
39107835--39107882
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
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29
2.0
29
92
0
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26
0
29
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1.55
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14
3.3
14
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48
13
0
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1.42
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38
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0
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21
20
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42
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24
24
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1.98
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2.0
14
100
0
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14
14
35
1.86
39123625--39123806
27
6.7
27
86
5
244
41
17
15
26
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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