Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  22  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
77
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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19
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30
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1.9
93
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19
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1.9
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13
13
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0
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2.0
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0
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0
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33
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1
0
41
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.93
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2.5
92
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15
23
20
1.91
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5
0
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2.3
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0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5921383--5921421
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2.0
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0
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1
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2.1
23
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4
60
59
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0
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1.09
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3.5
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0
4
17
0.92
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65
77
0
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1
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0
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0
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19
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0
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10
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14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
5929046--5929092
19
2.5
19
86
6
60
21
6
0
72
1.07
5931682--5931719
18
2.3
16
80
20
51
63
0
7
28
1.23
5931686--5931719
18
1.9
17
94
5
59
64
0
8
26
1.22
5931692--5931734
21
2.0
21
86
0
59
62
2
9
25
1.37
5948246--5948275
3
10.0
3
100
0
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0
0
33
0.92
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4
7.5
4
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7
53
0
29
0
70
0.87
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3
28.3
3
68
22
50
61
4
0
33
1.17
5949136--5949215
21
3.7
21
75
18
67
62
5
0
32
1.17
5954304--5954416
51
2.3
51
81
4
133
41
23
19
15
1.90
5954719--5954748
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5955617--5955694
21
3.6
21
74
19
63
61
5
0
33
1.18
5961384--5961434
16
2.8
20
74
22
65
33
23
5
37
1.79
5962797--5963001
79
2.6
79
82
3
234
25
26
21
26
2.00
5962797--5963013
39
5.5
40
84
6
246
25
26
22
25
2.00
5970892--5971110
40
5.5
39
82
8
226
24
26
22
26
2.00
5970892--5971111
80
2.7
80
83
4
273
25
26
22
25
2.00
5970892--5971110
120
1.8
121
86
3
316
24
26
22
26
2.00
5978611--5978641
2
15.5
2
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0
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0
0
48
1.00
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0
31
0
0.90
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46
3.8
46
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0
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39
14
22
23
1.91
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29
2.0
29
100
0
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45
13
20
20
1.84
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75
1.9
75
95
0
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43
14
22
20
1.87
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46
4.7
46
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3
316
44
15
22
18
1.86
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121
2.0
121
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0
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42
15
21
20
1.88
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1.9
92
100
0
350
43
15
22
18
1.88
5980827--5981155
167
2.0
167
93
0
559
41
15
22
20
1.89
5984024--5984180
27
5.8
27
87
0
197
30
22
7
39
1.82
5983999--5984208
54
3.9
52
78
7
150
33
22
7
36
1.83
5984159--5984516
27
13.2
27
74
9
201
39
21
8
30
1.84
5984011--5984209
81
2.5
81
80
1
238
34
21
7
36
1.82
5984105--5984518
54
7.6
54
75
5
237
38
20
8
32
1.83
5984159--5984435
81
3.4
80
80
6
274
39
22
8
29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5985386--5985537
52
3.0
52
97
1
281
26
23
23
26
2.00
5985388--5985537
26
5.8
26
92
0
241
26
24
23
26
2.00
5985876--5985957
26
3.2
26
87
6
121
31
4
24
39
1.76
5988713--5988804
42
2.2
42
92
0
148
29
14
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34
1.93
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2
18.0
2
94
5
63
51
0
0
48
1.00
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24
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4
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0
17
2
0.82
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4.2
11
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8
58
80
0
17
2
0.81
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16
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2
30
0
1.05
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5997553--5997874
46
7.0
46
93
0
491
41
14
22
21
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318