Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  33  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9037081--9037419
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25
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18
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22
3
0
73
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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9141665--9141799
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2.0
20
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17
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22
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21
80
10
68
46
28
1
23
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.98
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1.56
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138
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1.55
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0
50
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0
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0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9239640--9241529
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5
7
42
1.54
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3.2
138
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2
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45
5
7
41
1.55
9256126--9256278
75
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76
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23
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1.99
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23
29
22
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46
2.7
46
92
0
207
26
21
28
23
1.99
9290277--9290478
46
4.4
47
81
6
198
29
18
27
24
1.98
9290277--9290444
92
1.8
92
84
5
232
29
19
27
23
1.98
9291484--9291547
28
2.3
28
97
0
119
14
20
48
17
1.81
9296373--9296548
46
3.8
46
79
12
207
20
20
29
29
1.98
9296370--9296540
93
1.8
93
93
0
297
20
21
29
28
1.98
9301409--9301448
18
2.2
18
86
8
55
22
0
2
75
0.93
9307768--9307833
22
2.7
24
82
15
82
50
1
6
42
1.36
9308919--9308950
14
2.3
14
100
0
64
15
12
21
50
1.77
9309619--9309687
2
34.5
2
94
0
120
1
1
47
49
1.19
9314119--9314153
17
2.0
18
88
5
54
34
0
14
51
1.42
9314302--9314426
21
6.0
21
80
3
119
17
21
15
45
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9314679--9314749
37
1.9
37
91
5
117
38
16
8
36
1.80
9319635--9319661
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
9321345--9321383
17
2.3
17
86
8
53
30
0
20
48
1.50
9321522--9321654
21
6.3
21
79
3
133
19
20
14
45
1.84
9323652--9323707
28
2.0
28
92
0
94
37
19
16
26
1.92
9330964--9331022
28
2.1
29
81
6
68
49
22
8
20
1.75
9335912--9335995
28
3.2
28
65
25
83
23
16
29
29
1.96
9335808--9336039
49
4.7
49
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3
293
25
17
27
29
1.98
9339134--9339181
15
3.2
15
96
0
87
16
12
12
58
1.63
9339123--9339216
30
3.1
31
76
10
97
12
17
17
53
1.73
9341948--9342190
50
4.8
51
85
1
310
25
18
26
29
1.98
9341951--9342190
51
4.8
50
84
1
309
25
19
26
29
1.98
9341951--9342183
101
2.3
101
99
0
457
25
18
26
29
1.98
9360394--9360616
40
5.6
40
84
7
283
25
26
23
25
2.00
9360394--9360616
83
2.8
79
85
7
281
25
26
23
25
2.00
9363103--9363140
20
2.0
20
94
5
69
42
31
2
23
1.68
9372022--9372241
46
4.8
44
76
11
165
28
18
29
24
1.98
9373993--9374022
14
2.2
13
94
5
51
40
0
0
60
0.97
9376520--9376640
37
3.2
37
65
21
104
48
3
9
38
1.51
9393262--9393302
21
2.0
21
95
0
73
51
7
26
14
1.69
9395457--9395486
14
2.2
14
94
5
53
13
0
0
86
0.57
9403108--9403151
20
2.1
21
87
4
63
50
6
9
34
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9403123--9403227
29
3.8
28
76
17
103
56
4
5
33
1.44
9403129--9403193
25
2.5
27
72
23
66
53
4
6
35
1.46
9403409--9403448
19
2.0
21
85
9
57
55
7
2
35
1.42
9403399--9403454
21
2.6
22
80
11
62
51
8
1
37
1.44
9403471--9403638
23
7.0
24
69
22
70
58
4
5
32
1.40
9403475--9403674
24
8.2
24
74
17
139
58
5
4
32
1.40
9403381--9403653
47
5.8
46
74
19
196
57
5
4
32
1.40
9403718--9403758
14
2.7
16
77
14
50
53
7
0
39
1.29
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2.1
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80
13
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0
4
33
1.17
9405057--9405182
49
2.6
49
94
0
216
34
15
18
31
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318