Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  84  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2.0
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206
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1
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0
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50
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2.3
43
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9.3
27
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26
20
17
36
1.94
25091741--25091987
80
3.1
80
83
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304
26
20
16
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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25092024--25092393
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106
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9
20
38
1.84
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5.8
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10
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21
1.81
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20
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1.9
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28
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26
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25134172--25134359
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4.7
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22
26
2.00
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2.7
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169
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14
25
35
1.93
25138565--25138701
43
3.2
42
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161
27
13
23
35
1.93
25138563--25138720
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3.7
43
80
8
110
28
13
23
34
1.93
25143137--25143330
48
4.0
48
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1
318
25
31
18
23
1.97
25144880--25145046
40
4.2
40
81
2
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23
26
22
26
2.00
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26
2.0
26
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0
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20
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12
13
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2.0
73
98
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26
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26
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2.00
25151703--25151853
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3.8
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7
148
22
25
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25162551--25162727
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23
22
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25
2.00
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19
27
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1.98
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16
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18
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18
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1.95
25176200--25176363
71
2.3
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100
0
328
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17
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1.94
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20
28
17
33
1.95
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26
22
14
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1.97
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28
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32
1.97
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5.6
40
88
2
304
22
21
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25230468--25230685
79
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296
23
21
27
28
1.99
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1.9
119
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329
22
21
27
27
1.99
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79
3.2
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244
24
20
27
27
1.99
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119
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21
27
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23
28
25
1.99
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23
28
25
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19
25
1.98
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3.7
43
76
10
135
30
26
19
23
1.98
25251366--25251533
43
3.9
43
83
5
198
32
23
14
29
1.94
25251364--25251534
86
2.0
85
83
3
218
33
23
14
29
1.93
25252014--25252077
29
2.2
30
81
13
71
29
29
0
40
1.57
25259546--25259572
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
25260503--25260538
14
2.6
14
95
0
63
33
8
0
58
1.28
25261306--25261339
17
2.0
17
88
11
52
32
0
0
67
0.91
25264010--25264116
43
2.5
42
81
3
133
21
17
28
32
1.96
25273552--25273730
39
4.7
39
90
6
285
26
21
29
22
1.99
25273587--25273658
35
2.2
30
78
21
99
26
20
29
23
1.99
25273552--25273730
74
2.3
77
90
5
283
26
21
29
22
1.99
25281517--25281617
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
25284743--25284886
39
3.7
39
92
0
243
26
20
29
22
1.99
25284744--25284926
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
25293215--25293260
23
2.0
23
100
0
92
30
8
8
52
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25293955--25294007
13
4.1
13
90
0
88
26
30
33
9
1.88
25293947--25294003
26
2.2
25
87
6
87
28
33
31
7
1.84
25296989--25297031
15
3.0
15
83
6
54
48
37
0
13
1.43
25305691--25305729
19
2.1
19
100
0
78
69
10
0
20
1.17
25312907--25313010
33
3.3
34
74
19
91
25
23
25
25
2.00
25314011--25314057
22
2.0
22
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8
58
53
14
4
27
1.60
25314740--25314963
39
5.7
39
92
0
358
30
25
21
23
1.99
25322788--25323011
39
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39
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0
331
29
25
21
22
1.99
25331774--25331905
29
4.6
29
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25
32
16
25
1.96
25339114--25339245
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4.6
29
83
1
149
25
32
16
25
1.96
25347052--25347206
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3.7
43
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24
15
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1.95
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26
2.3
26
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5
75
33
8
10
47
1.68
25354509--25354661
39
3.9
39
92
0
243
23
20
31
24
1.98
25354510--25354692
39
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39
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0
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23
22
30
23
1.99
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40
4.4
40
79
9
175
24
21
27
27
1.99
25361219--25361395
80
2.2
80
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3
241
24
21
27
27
1.99
25361623--25361664
22
1.9
22
85
9
59
33
9
14
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1.78
25372401--25372518
44
2.7
44
83
0
155
24
16
28
30
1.96
25376898--25377070
46
3.7
46
75
15
167
30
26
20
23
1.99
25376904--25377073
93
1.8
93
90
0
277
29
27
20
23
1.99
25377491--25377550
30
2.0
30
86
0
84
30
25
6
38
1.81
25399242--25399278
18
2.1
18
90
10
58
13
24
43
18
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25401761--25401851
42
2.2
43
80
6
105
31
21
27
18
1.97
25404649--25404716
33
2.1
33
97
0
127
38
5
23
32
1.79
25406246--25406443
71
2.8
70
89
5
276
32
18
28
20
1.96
25406280--25406443
71
2.3
71
97
0
310
34
18
28
18
1.95
25408364--25408398
15
2.4
15
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4
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25
28
8
37
1.85
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4
100
0
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53
0
0
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1.00
25414730--25414784
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2.0
28
100
0
110
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10
20
1.80
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23
80
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1.92
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5.1
35
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0
153
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19
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29
1.86
25429823--25430002
70
2.6
70
77
0
180
40
17
10
31
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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