Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  21  of  318  ( 38146 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
5475507--5475544
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10
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13
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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2.9
11
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0
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133
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18
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30
1.96
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341
33
18
18
28
1.95
5579915--5580381
181
2.6
175
83
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490
33
18
19
28
1.95
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1.9
175
84
3
443
34
19
18
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.96
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1.34
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1
139
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1
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1.30
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1.32
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2
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2.0
23
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0
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41
34
6
17
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5616768--5616820
24
2.2
24
86
0
70
50
7
5
35
1.54
5622633--5622821
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2.0
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32
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2.2
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11
116
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40
3
10
1.54
5629751--5629926
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61.3
3
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2
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17
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28
2
2
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26
8
1
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2.5
25
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4
3
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1.33
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1.92
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181
2.2
181
88
0
587
33
17
20
28
1.96
5645500--5645605
44
2.5
43
83
4
117
30
20
19
29
1.97
5645733--5646010
88
3.2
85
78
8
258
32
20
19
26
1.97
5645733--5646010
44
6.4
43
72
11
199
32
20
19
26
1.97
5647528--5648016
3
163.0
3
69
15
198
29
7
1
61
1.32
5647765--5647799
17
2.1
17
94
0
61
22
8
0
68
1.16
5647803--5647860
26
2.3
26
77
19
68
32
5
1
60
1.29
5651269--5651331
28
2.3
28
80
17
71
66
4
9
19
1.38
5651798--5651845
23
2.1
23
92
0
78
39
14
6
39
1.71
5655467--5655508
22
1.9
22
100
0
84
42
0
23
33
1.55
5657567--5657618
16
3.2
15
75
17
50
38
0
1
59
1.08
5669247--5669287
21
2.0
21
95
0
73
29
26
29
14
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5670353--5670623
47
5.7
48
71
9
180
23
29
18
28
1.98
5675658--5676027
47
7.8
47
72
11
224
22
29
19
27
1.98
5681260--5681298
20
2.0
20
100
0
78
30
25
12
30
1.93
5681419--5681462
18
2.4
18
84
0
61
45
22
4
27
1.72
5683122--5683165
23
1.9
23
81
9
54
38
6
0
54
1.27
5718798--5718850
25
2.1
25
100
0
106
32
18
18
30
1.96
5721208--5721252
6
7.3
6
80
5
54
64
4
17
13
1.44
5722814--5722886
5
14.4
5
97
2
137
41
0
0
58
0.98
5722936--5722961
10
2.6
10
100
0
52
73
7
19
0
1.07
5722935--5723010
6
14.6
5
71
21
50
73
5
21
0
1.02
5722931--5723010
16
4.7
17
74
19
69
72
5
22
0
1.04
5722986--5723019
12
2.8
12
91
8
52
73
0
26
0
0.83
5731476--5731528
3
17.7
3
100
0
106
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0
0
33
0.92
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67
2.0
67
100
0
274
32
16
16
34
1.91
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2
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0
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0
0
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1.00
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2.6
38
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1
119
36
19
18
27
1.94
5751916--5751993
39
2.0
39
97
0
147
44
17
5
32
1.71
5756609--5756736
66
1.9
66
88
3
195
40
12
22
24
1.88
5758314--5758354
20
2.0
20
90
0
64
26
0
12
60
1.31
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15
2.6
15
87
0
51
25
10
7
56
1.59
5771193--5771290
33
3.0
33
92
0
160
21
9
40
28
1.84
5779106--5779168
3
21.3
3
96
3
119
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5781710--5781892
39
4.6
39
84
0
222
23
30
21
24
1.99
5783946--5784068
50
2.5
50
79
10
126
30
13
18
37
1.89
5784310--5784451
44
3.1
42
72
20
115
27
20
19
32
1.97
5784167--5784451
94
3.0
94
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5
256
29
19
17
32
1.95
5805701--5805735
17
2.1
17
100
0
70
37
0
17
45
1.48
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63
2.0
63
100
0
254
27
11
29
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19
1.9
19
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0
11
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9
3.3
9
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9
51
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20
0
10
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20
0
11
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5814834--5814881
2
24.5
2
95
4
89
0
50
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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