Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr02 99090824 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  99090824

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  27  of  318  ( 38146 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7245888--7245943
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26
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1.99
7247345--7247564
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5.5
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216
26
26
21
25
1.99
7255432--7255650
40
5.5
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84
5
226
23
26
23
26
2.00
7255432--7255651
80
2.7
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2
269
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26
23
25
2.00
7258737--7259259
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12.2
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7258737--7259259
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21
32
16
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1.95
7258747--7259252
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3.0
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16
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1.95
7271621--7271694
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0
0
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25
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1.27
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1.9
20
89
5
60
48
0
7
43
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7298431--7298491
6
9.8
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3
1
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1.06
7301546--7301590
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2.8
17
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12
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2
2
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1.26
7301546--7301579
18
1.9
18
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2
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20
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57
25
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1.40
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14
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1.61
7302644--7302701
21
2.8
21
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20
1.60
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1.60
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21
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1.9
91
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2.2
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19
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0
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0
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1.51
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37
2.1
37
92
0
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20
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3.0
133
92
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17
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1.98
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2.4
26
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1
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1.16
7316379--7316426
26
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4
0
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12
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0
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1.00
7316381--7316442
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2.6
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12
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69
4
0
25
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
0
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1.12
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.2
25
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5
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1.47
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2.2
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123
2
8
13
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1.12
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4.9
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30
21
17
30
1.96
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151
2.5
151
87
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504
30
21
17
30
1.96
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2.0
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16
16
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18
16
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1.94
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1.9
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144
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18
14
28
1.90
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2.5
13
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4
50
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5
11
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1.55
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2.3
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15
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1.89
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2.8
24
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22
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55
4
5
33
1.44
7335765--7335812
2
24.5
2
93
4
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52
0
2
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1.12
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2.2
25
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15
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5
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1.47
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2.2
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2
139
2
6
13
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1.08
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2
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64
2
2
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1.16
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0
0
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0
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1.9
31
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6
86
41
5
13
40
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7362253--7362284
17
1.9
16
93
6
55
31
40
12
15
1.85
7362542--7362588
23
2.0
23
95
0
85
25
19
4
51
1.65
7363281--7363327
2
23.5
2
100
0
94
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48
0
0
1.00
7368646--7368681
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2.1
18
89
5
56
25
5
5
63
1.38
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2.5
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79
5
157
30
19
22
27
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1.9
18
100
0
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65
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11
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0
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28
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20
24
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46
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2.3
20
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34
0
10
55
1.35
7390550--7390613
18
3.6
18
79
10
60
62
0
7
29
1.23
7390717--7390775
27
2.2
27
90
6
93
27
1
1
69
1.07
7390718--7390775
9
6.2
9
80
13
64
25
1
1
70
1.06
7390795--7390848
17
2.9
18
78
13
56
25
3
3
66
1.25
7390790--7390851
20
3.3
19
75
13
56
29
3
3
64
1.25
7392580--7392604
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
7392963--7393030
33
2.1
33
100
0
136
30
2
27
38
1.72
7393599--7393640
2
21.5
2
95
4
77
52
0
0
47
1.00
7394498--7394522
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
7396636--7396668
17
2.0
17
94
5
59
51
6
6
36
1.51
7397733--7397765
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7405998--7406028
7
4.4
7
100
0
62
41
12
0
45
1.42
7409380--7409458
33
2.4
34
79
12
92
37
18
1
41
1.59
7410592--7410670
35
2.4
34
79
10
85
51
5
0
43
1.23
7410763--7410848
28
3.1
28
76
11
70
39
5
0
54
1.24
7410814--7410850
16
2.3
17
81
13
51
48
0
0
51
1.00
7416244--7416303
21
2.9
21
76
0
66
41
18
26
13
1.87
7416270--7416391
41
2.9
41
79
7
129
41
19
22
16
1.90
7416320--7416399
21
3.9
21
67
14
58
43
17
18
20
1.88
7422404--7422431
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
7431857--7431895
19
2.0
20
90
5
62
33
7
5
53
1.51
7443194--7443233
16
2.5
16
100
0
80
12
17
15
55
1.70
7443972--7444017
22
2.1
21
88
8
65
0
26
0
73
0.83
7452938--7453092
42
3.7
42
76
7
136
30
23
15
29
1.95
7459963--7460001
12
3.5
11
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10
53
0
28
0
71
0.86
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3
17.3
3
100
0
104
32
0
0
67
0.91
7467093--7467131
21
1.9
20
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5
51
25
12
25
35
1.92
7472703--7472767
26
2.5
26
83
14
80
70
0
16
12
1.16
7472702--7472768
25
2.7
25
82
15
77
70
0
17
11
1.17
7474951--7475028
37
2.2
35
84
9
95
25
2
5
66
1.25
7475909--7475942
15
2.2
16
89
5
52
67
0
0
32
0.91
7476684--7476727
21
2.2
20
83
4
52
29
2
2
65
1.16
7483363--7483395
16
2.1
16
94
0
57
39
0
3
57
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7483951--7483992
3
14.7
3
90
9
70
28
0
0
71
0.86
7484690--7484729
20
2.0
21
85
5
55
30
7
5
57
1.48
7485839--7485886
26
2.0
22
84
15
60
37
10
10
41
1.74
7490665--7490689
5
5.0
5
100
0
50
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0
0
20
0.72
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33
1.9
33
96
0
117
30
23
23
22
1.99
7497712--7497749
16
2.4
16
86
8
51
73
2
0
23
0.95
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26
2.3
25
80
11
64
75
3
10
10
1.15
7507465--7507636
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1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
7507458--7507633
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3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
7515044--7515215
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318