Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  10  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2949435--2949469
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3.9
9
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0
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1.72
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100
0
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0
0
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1.00
2953547--2953616
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2.3
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0
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42
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12
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1.71
2954406--2954466
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2.0
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2957434--2957508
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14
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2959120--2959358
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4.8
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282
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2.3
100
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29
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18
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1.98
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2.0
29
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27
27
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11
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2
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1
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26
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2
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2.1
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0
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0
0
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0.95
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23
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1
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1.32
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24
2.1
24
96
0
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13
3
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1.62
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2.5
17
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3
50
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9
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1.29
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6
78
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4
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0
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2.9
13
82
13
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57
5
0
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1.9
77
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4
206
51
8
10
29
1.66
2985645--2985703
30
1.9
31
83
10
77
22
11
22
44
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2990177--2990235
30
1.9
31
83
10
77
22
11
22
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2995616--2995642
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100
0
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0
0
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1
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2.2
33
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1
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2.1
22
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33
2.0
33
100
0
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20
1.71
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14
2.3
15
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5
59
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1.80
3023125--3023176
4
13.0
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15
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42
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3
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1.39
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3.2
20
100
0
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2.3
40
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145
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1.24
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1.38
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2.3
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0
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0.98
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22
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21
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15
1.21
3035160--3035192
15
2.1
17
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11
52
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3
0
27
1.03
3037732--3037784
27
2.0
27
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22
22
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24
1.99
3042925--3042952
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2.0
14
100
0
56
21
14
21
42
1.88
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20
1.9
19
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10
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5
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23
1.9
23
85
0
61
54
9
0
36
1.32
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23
2.2
23
81
0
55
56
8
2
34
1.40
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15
3.1
15
82
14
60
29
8
19
42
1.80
3057993--3058038
16
2.9
16
81
15
60
28
8
19
43
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
81
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6
34
0
1.24
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39
3.4
39
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114
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20
27
28
1.99
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131
2.6
129
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484
28
17
19
34
1.95
3095732--3095788
24
2.3
25
79
11
73
10
15
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9
4.4
9
90
0
62
10
27
50
12
1.72
3097321--3097364
18
2.4
18
100
0
88
9
27
52
11
1.67
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16
2.1
17
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5
63
25
11
0
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1.28
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0
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1.06
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2.5
20
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12
66
29
0
2
68
1.01
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5.5
18
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16
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33
0
1
63
1.11
3098321--3098374
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2.0
28
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10
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29
0
1
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0
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14
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0
52
25
2
5
65
1.28
3124119--3124146
14
2.0
14
100
0
56
21
0
7
71
1.09
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2.1
31
100
0
130
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9
12
52
1.68
3126401--3126618
121
1.8
121
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4
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16
17
28
1.91
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19
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11
2
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2.4
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10
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9
9
9
1.28
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24
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0
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4
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1.67
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177
2.2
176
92
0
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19
23
18
38
1.93
3129638--3130077
177
2.5
175
86
4
630
20
23
17
38
1.93
3134122--3134300
89
2.0
89
100
0
358
34
11
10
44
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3139262--3139302
15
2.5
17
80
11
59
65
0
0
34
0.93
3140128--3140184
19
3.1
19
87
7
73
35
0
7
57
1.26
3140499--3140557
31
1.9
31
86
6
84
37
6
13
42
1.71
3152043--3152106
29
2.2
29
91
2
103
35
26
15
21
1.94
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9
3.7
9
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50
73
0
2
23
0.97
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1.9
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3
166
41
15
15
27
1.87
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2.0
26
100
0
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33
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22
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1.83
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15
100
0
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50
52
4
3
39
1.38
3175652--3175685
16
2.1
16
94
0
59
35
0
2
61
1.11
3177792--3177835
24
1.9
22
86
9
61
52
0
4
43
1.22
3177766--3177851
37
2.5
35
83
9
97
51
1
4
43
1.30
3192810--3193077
133
2.0
133
94
0
473
40
22
13
24
1.89
3198458--3198513
29
1.9
29
85
0
76
28
0
41
30
1.57
3198714--3198757
12
3.7
12
93
0
70
18
38
40
2
1.63
3198825--3198868
3
14.7
3
80
0
52
29
6
0
63
1.20
3198975--3199037
19
3.4
19
76
14
69
33
3
3
60
1.28
3198979--3199011
16
2.1
16
94
0
57
39
6
3
51
1.42
3199722--3199803
30
2.7
30
92
0
128
17
48
8
25
1.75
3200116--3200148
16
2.1
16
94
0
57
51
3
6
39
1.42
3200227--3200272
21
2.2
21
84
3
58
76
0
4
19
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3200224--3200272
15
3.3
15
82
5
55
75
0
4
20
0.96
3200693--3200774
30
2.7
30
90
0
128
24
7
50
18
1.72
3206151--3206197
24
2.0
24
84
12
62
46
10
6
36
1.64
3207827--3208068
120
2.0
120
94
0
421
30
15
12
42
1.83
3221286--3221376
3
29.3
3
71
22
64
65
0
3
30
1.08
3221230--3221374
27
5.2
27
77
17
113
66
2
3
26
1.21
3221299--3221414
20
5.7
21
76
18
95
61
0
5
32
1.24
3221268--3221346
31
2.4
32
83
10
97
65
1
2
30
1.13
3221286--3221384
32
3.0
31
78
14
85
65
0
4
30
1.11
3221285--3221380
15
6.9
14
76
22
78
65
0
4
30
1.11
3221229--3221376
11
14.9
10
69
27
79
66
2
3
27
1.21
3221400--3221483
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
3221404--3221492
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
3223271--3223321
16
3.2
16
97
0
93
52
13
11
21
1.72
3224240--3224273
16
2.1
17
94
5
61
23
11
0
64
1.26
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11
2.4
11
100
0
52
30
0
15
53
1.42
3230240--3230268
15
2.0
15
93
6
51
31
6
6
55
1.53
3230330--3230360
13
2.4
13
94
0
53
74
0
0
25
0.82
3230349--3230402
21
2.6
20
75
18
56
42
5
11
40
1.64
3231895--3231941
22
2.1
22
96
0
85
38
0
19
42
1.51
3232639--3232687
9
5.7
9
76
16
50
73
0
0
26
0.83
3232653--3232710
20
3.0
20
77
18
54
68
3
0
27
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3233336--3233557
107
2.1
108
89
0
338
27
32
12
27
1.93
3233522--3233587
30
2.2
30
89
5
98
18
42
10
28
1.83
3235207--3235266
30
2.0
30
90
0
93
58
13
1
26
1.45
3237183--3237208
11
2.4
11
100
0
52
30
0
15
53
1.42
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19
1.9
19
88
0
56
67
0
0
32
0.91
3239975--3240014
21
1.9
21
100
0
80
45
0
17
37
1.49
3241395--3241587
107
1.8
106
88
3
298
29
30
12
27
1.93
3245246--3245271
11
2.4
11
100
0
52
30
0
15
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2.0
15
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6
51
31
6
6
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13
2.4
13
94
0
53
74
0
0
25
0.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325