Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  8  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
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2326365--2326570
10
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10
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15
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27
3
0
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1.05
2327071--2327126
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25
3
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1.02
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20
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3
0
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2.1
20
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30
0
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1.03
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18
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2.0
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27
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6
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0
14
52
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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3
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1.30
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103
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9
17
29
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2419104--2419168
21
3.1
21
78
10
71
64
0
3
32
1.09
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2.5
15
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53
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0
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1.14
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2.3
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8
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1.27
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66
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42
9
10
37
1.71
2471217--2471265
25
2.0
25
88
8
73
73
0
10
16
1.09
2474166--2474190
13
1.9
13
100
0
50
64
16
4
16
1.44
2481741--2481789
18
2.5
21
78
21
61
61
0
0
38
0.96
2481753--2481800
16
3.0
16
78
6
53
64
0
2
33
1.05
2483959--2483988
13
2.2
14
94
5
53
56
16
0
26
1.40
2490313--2490354
21
2.0
21
90
0
66
30
26
14
28
1.95
2491674--2491703
15
2.0
15
93
0
51
66
3
20
10
1.35
2491710--2491745
4
9.0
4
100
0
72
50
25
0
25
1.50
2506705--2506879
41
4.3
41
91
1
280
29
19
28
23
1.98
2514085--2514121
19
1.9
19
94
0
65
35
0
18
45
1.50
2514335--2514510
41
4.3
41
90
0
271
30
19
27
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2514335--2514504
82
2.1
82
97
0
322
30
18
27
23
1.98
2516214--2516257
19
2.3
19
100
0
88
63
0
11
25
1.27
2517688--2517721
15
2.2
16
89
5
52
64
0
2
32
1.08
2519520--2519577
21
2.7
21
81
10
64
43
0
0
56
0.99
2520181--2520219
19
2.0
20
90
5
62
58
2
0
38
1.12
2523912--2523946
13
2.6
14
86
9
54
45
0
0
54
0.99
2523912--2523965
28
2.0
27
82
10
65
48
0
1
50
1.11
2528971--2529010
20
2.0
20
85
9
55
40
42
5
12
1.64
2532369--2532548
86
2.1
85
97
2
344
40
3
7
47
1.51
2532615--2532717
51
2.0
50
94
5
181
45
18
7
28
1.77
2532663--2532773
33
3.4
34
82
10
115
43
17
8
31
1.78
2535890--2535924
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
2535799--2536182
120
3.2
120
95
2
716
44
2
5
47
1.40
2536131--2536165
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
2536330--2536420
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
2536401--2536469
16
4.2
16
92
3
120
36
37
1
24
1.65
2536401--2536469
33
2.1
32
94
2
120
36
37
1
24
1.65
2541942--2541974
17
1.9
17
93
0
57
15
9
0
75
1.03
2544295--2544349
25
2.2
26
83
9
69
58
7
9
25
1.55
2547218--2547304
43
2.0
44
88
2
131
21
20
21
35
1.96
2550551--2550584
16
2.1
16
100
0
68
17
11
38
32
1.86
2559209--2559263
25
2.2
26
83
9
69
58
7
9
25
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2561784--2561853
31
2.3
31
85
5
97
24
28
12
34
1.92
2562759--2562816
18
3.2
17
75
22
55
27
3
1
67
1.17
2562735--2562844
37
3.0
36
79
10
98
36
1
1
60
1.18
2564052--2564100
10
4.9
10
80
7
55
26
2
0
71
0.97
2568162--2568202
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
2575607--2575633
7
3.9
7
100
0
54
55
0
0
44
0.99
2581814--2581838
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
2588556--2588632
20
4.0
18
74
12
64
62
2
3
31
1.27
2596116--2596161
23
2.0
23
100
0
92
47
17
13
21
1.81
2596439--2596504
31
2.3
27
78
17
69
34
3
16
45
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325