Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  245  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80154027--80154086
16
3.7
15
80
12
57
63
0
1
35
1.05
80159020--80159057
19
2.1
18
90
5
58
50
2
2
44
1.30
80172876--80172928
23
2.4
21
77
20
54
49
7
9
33
1.64
80172879--80172925
23
2.0
23
84
12
60
42
8
10
38
1.70
80181785--80181832
24
2.1
23
85
11
64
54
0
14
31
1.41
80182315--80182470
41
3.8
41
87
6
217
28
20
21
28
1.98
80182689--80182764
33
2.5
32
82
14
99
31
7
23
36
1.84
80182687--80182752
33
2.0
32
91
2
105
30
9
22
37
1.85
80189410--80189457
24
2.1
23
85
11
64
54
0
14
31
1.41
80189940--80190095
41
3.8
41
89
6
235
28
20
22
28
1.98
80192127--80192190
22
2.9
22
95
4
112
64
4
9
21
1.42
80192114--80192157
15
2.9
15
80
9
54
65
4
9
20
1.38
80195648--80195705
22
2.7
22
82
15
68
22
17
22
37
1.93
80198065--80198310
136
1.8
136
83
0
330
30
25
22
21
1.99
80206101--80206146
21
2.2
21
84
7
58
67
2
0
30
1.03
80206143--80206179
19
2.0
19
89
5
58
54
10
2
32
1.49
80206156--80206204
25
1.9
26
83
4
64
53
4
0
42
1.20
80206184--80206230
10
4.7
10
81
7
60
68
2
2
27
1.13
80206184--80206230
19
2.3
21
89
7
71
68
2
2
27
1.13
80206184--80206260
39
2.0
40
82
7
95
61
2
2
33
1.24
80215272--80215328
29
2.0
29
89
3
89
33
26
21
19
1.97
80219067--80219193
33
3.9
33
82
6
150
19
22
15
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80219065--80219193
65
2.0
66
83
4
163
19
22
16
41
1.90
80220521--80220749
81
2.8
81
85
2
298
26
15
24
34
1.95
80220514--80220796
122
2.3
122
84
3
347
26
15
24
33
1.95
80220521--80220790
41
6.7
41
80
4
280
25
15
24
34
1.95
80225238--80225283
21
2.2
21
100
0
92
52
0
4
43
1.21
80228869--80228902
17
1.9
17
88
5
50
79
0
0
20
0.73
80230501--80230537
18
2.1
18
94
0
65
64
0
5
29
1.15
80230706--80230738
11
2.8
12
90
9
50
69
0
30
0
0.88
80232228--80232277
24
2.1
24
92
0
82
30
14
10
46
1.77
80240538--80240638
13
7.8
13
76
6
89
44
2
16
35
1.63
80240558--80240636
39
2.1
38
85
7
106
40
3
18
36
1.69
80241569--80241763
38
5.0
38
86
3
230
31
25
21
21
1.98
80255510--80255541
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
80255537--80255599
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
38
1.38
80255566--80255595
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
80257096--80257142
15
3.3
14
82
11
60
76
0
2
21
0.89
80268696--80268967
108
2.5
110
78
8
270
36
15
22
25
1.94
80268976--80269140
59
2.8
59
85
0
213
24
21
22
31
1.98
80273618--80273661
14
3.0
14
81
12
52
38
0
0
61
0.96
80273623--80273663
16
2.5
17
84
11
59
34
0
0
65
0.93
80274210--80274331
10
12.6
9
69
18
59
57
2
0
39
1.18
80274231--80274275
19
2.5
18
82
10
65
57
2
0
40
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80274663--80274687
13
1.9
13
100
0
50
48
0
12
40
1.40
80277794--80277823
13
2.2
14
94
5
53
23
36
3
36
1.71
80280280--80280368
40
2.2
40
84
7
110
29
23
13
33
1.93
80281513--80281750
50
4.8
50
87
3
327
27
19
30
22
1.98
80284433--80284457
12
2.1
12
100
0
50
32
16
8
44
1.76
80293623--80293713
40
2.3
40
90
3
139
34
19
20
25
1.97
80293646--80293750
40
2.6
40
83
8
117
29
19
20
30
1.97
80294307--80294351
22
2.0
22
82
0
54
22
0
33
44
1.53
80294312--80294346
15
2.4
15
90
4
54
20
0
34
45
1.51
80294374--80294449
14
5.4
14
71
6
55
19
1
34
44
1.59
80294410--80294463
28
1.9
28
81
7
65
27
0
24
48
1.52
80294609--80294660
22
2.4
22
83
3
79
28
1
23
46
1.63
80294669--80294714
21
2.2
21
88
0
65
23
0
41
34
1.55
80294681--80294713
14
2.4
14
100
0
66
21
0
48
30
1.50
80294681--80294714
7
4.9
7
88
0
50
23
0
47
29
1.52
80295050--80295098
19
2.7
18
84
6
62
75
4
2
18
1.06
80295636--80295682
23
2.0
23
95
0
85
17
8
19
55
1.67
80309046--80309095
23
2.2
23
82
17
68
34
0
12
54
1.38
80309055--80309097
13
3.5
13
81
18
65
34
0
16
48
1.46
80309054--80309099
23
2.0
23
100
0
92
34
0
17
47
1.48
80310908--80311203
149
2.0
149
87
1
432
22
21
21
33
1.98
80313498--80313523
13
2.0
13
100
0
52
23
15
30
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80315041--80315088
18
2.8
18
87
6
64
33
4
0
62
1.14
80315108--80315156
17
3.0
16
82
11
64
32
0
10
57
1.32
80315115--80315154
15
2.6
15
84
4
53
32
0
7
60
1.25
80316177--80316215
19
2.1
19
85
0
51
46
7
2
43
1.46
80324425--80324492
34
2.0
34
97
0
127
45
20
16
17
1.85
80330566--80330902
88
3.9
84
83
6
383
26
16
20
37
1.93
80332130--80332188
21
2.8
21
77
12
66
81
6
3
8
0.97
80332140--80332184
20
2.2
20
88
7
65
84
4
4
6
0.87
80332747--80332793
18
2.7
18
87
6
62
34
4
0
61
1.15
80332814--80332862
17
3.0
16
82
11
64
32
0
10
57
1.32
80332821--80332860
15
2.6
15
84
4
53
32
0
7
60
1.25
80348743--80349330
86
6.9
86
79
8
569
26
17
19
36
1.94
80348920--80349243
161
2.0
162
86
3
447
28
17
20
34
1.95
80351055--80351112
29
2.0
29
93
0
98
20
20
24
34
1.97
80351207--80351253
18
2.7
18
87
6
62
36
4
0
59
1.17
80351274--80351322
17
3.0
16
82
11
64
32
0
10
57
1.32
80351281--80351320
15
2.6
15
84
4
53
32
0
7
60
1.25
80354304--80354346
13
3.5
13
81
18
65
48
16
0
34
1.46
80354302--80354347
23
2.0
23
100
0
92
47
17
0
34
1.48
80354306--80354355
23
2.2
23
89
7
75
54
14
0
32
1.40
80356522--80356598
31
2.5
32
77
10
88
40
0
3
55
1.18
80356563--80356607
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80358451--80358603
62
2.5
62
94
0
270
30
22
24
22
1.99
80358787--80359152
46
8.0
46
91
1
502
39
14
24
21
1.90
80359438--80359470
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
80360851--80360875
10
2.5
10
100
0
50
76
8
0
16
1.02
80362009--80362058
23
2.2
23
82
17
68
34
0
12
54
1.38
80362018--80362060
13
3.5
13
81
18
65
34
0
16
48
1.46
80362017--80362062
23
2.0
23
100
0
92
34
0
17
47
1.48
80367209--80367248
21
2.0
20
85
5
53
37
0
20
42
1.52
80368757--80368794
20
2.0
20
89
5
60
39
2
13
44
1.57
80369073--80369113
18
2.2
18
91
8
64
68
0
31
0
0.90
80369940--80369965
6
4.3
6
100
0
52
19
19
15
46
1.85
80375976--80376059
26
3.2
26
91
0
132
35
25
4
34
1.77
80376743--80376869
40
3.2
40
82
10
152
18
25
32
22
1.97
80377293--80377368
40
1.9
38
84
5
98
48
5
1
44
1.33
80377612--80377645
16
2.1
16
88
0
50
61
0
0
38
0.96
80378223--80378252
15
2.1
14
93
6
51
26
3
6
63
1.35
80380122--80380201
40
2.0
40
97
0
151
22
31
17
28
1.97
80380914--80381503
47
12.7
47
72
12
364
21
29
20
28
1.98
80380863--80381500
187
3.4
187
93
0
1073
21
29
19
28
1.98
80388805--80389102
149
2.0
149
85
0
398
33
21
22
22
1.97
80390929--80390971
13
3.5
13
81
18
65
48
16
0
34
1.46
80390927--80390972
23
2.0
23
100
0
92
47
17
0
34
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80394753--80394800
13
4.0
13
74
17
50
31
2
16
50
1.57
80403745--80403806
31
2.0
30
93
3
106
16
25
3
54
1.56
80406232--80406416
92
2.0
93
92
1
309
17
11
13
57
1.65
80406853--80406902
25
2.0
25
96
0
91
28
30
4
38
1.75
80408709--80408738
15
2.1
14
93
6
51
63
6
3
26
1.35
80409079--80409140
26
2.3
27
91
2
99
62
1
1
33
1.14
80412506--80412615
39
2.8
38
73
1
103
29
6
21
42
1.77
80419823--80420255
54
8.1
54
70
8
195
28
19
15
36
1.92
80420285--80420332
19
2.6
19
83
3
62
41
2
10
45
1.50
80420356--80420439
42
2.0
42
92
0
141
29
10
13
46
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325