Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  62  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19052610--19052646
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0
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2.0
166
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2.0
26
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2.1
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19117314--19117361
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2.1
22
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25
0
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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144
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23
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2.0
46
100
0
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27
16
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1.97
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27
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28
16
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1.97
19154067--19154218
54
2.8
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28
16
28
1.97
19162172--19162326
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5.7
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78
7
145
27
28
16
27
1.97
19162177--19162327
54
2.8
55
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5
182
27
27
16
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2.0
17
100
0
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5
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72
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39
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14
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1.9
133
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14
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1.93
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15
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1.93
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3.4
93
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12
303
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16
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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15
31
1.95
19197163--19197470
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3.4
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21
15
31
1.95
19197138--19197568
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1.9
227
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1.9
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16
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19264402--19264479
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1.00
19264420--19264479
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1.64
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16
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2.1
24
82
10
61
65
0
3
30
1.10
19290869--19291015
43
3.5
43
76
12
126
27
19
27
25
1.98
19293061--19293095
16
2.2
16
89
0
52
40
0
28
31
1.57
19293867--19293918
23
2.3
23
86
3
70
36
0
1
61
1.07
19303726--19303833
53
2.0
53
85
0
144
39
17
25
17
1.91
19307388--19307452
15
4.3
15
77
12
55
23
4
1
70
1.14
19307388--19307447
28
2.2
27
82
5
68
21
5
1
71
1.14
19307603--19307660
6
9.7
6
87
7
55
18
1
13
65
1.35
19307612--19307645
9
3.8
9
88
0
50
11
0
20
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1.21
19307632--19307674
3
14.3
3
85
0
59
30
4
2
62
1.28
19309056--19309083
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5
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0
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0
0
82
0.68
19311391--19311425
13
2.7
13
100
0
70
8
20
37
34
1.83
19313335--19313406
21
3.3
21
65
24
58
40
0
38
20
1.53
19313323--19313413
45
2.0
45
100
0
182
40
0
39
19
1.52
19313790--19313829
21
1.9
21
94
0
71
52
7
30
10
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19314194--19314246
19
2.8
19
83
13
65
30
20
5
43
1.75
19315228--19315400
86
2.0
86
95
0
310
35
22
21
19
1.96
19322359--19323235
44
19.5
43
74
7
266
34
16
18
30
1.94
19322356--19323254
89
10.0
89
77
6
650
34
16
19
30
1.94
19322356--19323254
133
6.6
133
77
7
684
34
16
19
30
1.94
19322867--19323174
96
3.4
94
77
12
327
34
14
21
30
1.93
19322660--19323209
229
2.4
228
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6
600
34
16
20
29
1.94
19322356--19323220
407
2.1
406
86
0
1194
34
16
19
30
1.93
19322987--19323254
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3.0
88
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1
340
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15
19
30
1.93
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3
16.3
3
91
0
80
30
2
2
65
1.15
19329268--19329342
38
2.0
38
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5
125
18
12
10
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1.61
19329978--19330029
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2.4
21
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77
53
3
1
40
1.30
19334239--19334314
24
3.3
24
83
10
104
38
19
21
21
1.94
19334248--19334316
21
3.1
21
82
11
84
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18
23
20
1.94
19349193--19349252
29
2.1
29
100
0
120
28
20
10
41
1.84
19351510--19351577
24
2.8
24
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2
73
42
16
19
22
1.89
19360928--19360986
30
1.9
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3
84
16
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33
20
1.95
19361948--19362096
52
2.8
51
82
3
163
34
28
12
24
1.91
19368526--19368584
30
1.9
31
89
3
93
16
30
33
18
1.94
19369371--19369454
41
2.0
41
95
0
150
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25
7
41
1.80
19369596--19369698
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2.0
52
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5
154
33
26
13
27
1.94
19373993--19374032
21
2.0
20
86
13
57
45
2
25
27
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19377670--19377733
24
2.7
24
82
0
74
25
35
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21
1.95
19392204--19392292
20
4.5
19
73
16
65
37
19
32
11
1.87
19392264--19392301
20
1.9
20
88
0
58
31
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34
21
1.91
19392263--19392307
20
2.3
19
81
11
54
35
13
33
17
1.89
19392258--19392393
60
2.3
60
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2
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19395009--19395047
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4
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0
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5
0
20
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43
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15
23
1.95
19399686--19399851
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1.9
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1.95
19404813--19404981
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2.1
78
80
7
189
26
20
27
25
1.99
19404757--19405014
40
6.5
38
75
11
182
26
21
27
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325