Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  269  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Score
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2.0
55
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211
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17
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88298828--88298965
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0
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57
1.12
88329030--88329073
11
3.8
11
80
11
52
47
2
2
47
1.27
88329194--88329254
33
1.9
30
83
9
77
42
0
3
54
1.17
88329583--88329611
13
2.1
14
93
6
51
82
0
10
6
0.83
88330823--88330923
47
2.1
47
82
7
116
25
18
20
34
1.96
88331017--88331111
48
2.0
48
85
0
127
38
7
15
37
1.76
88331069--88331118
18
2.6
20
84
9
68
42
0
16
42
1.47
88334414--88334493
30
2.6
30
82
5
90
35
0
6
58
1.23
88334440--88334491
9
5.4
9
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8
50
34
0
3
61
1.14
88336810--88336882
37
2.0
37
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10
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0
8
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1.32
88337522--88337558
9
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0
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29
10
13
45
1.77
88347771--88347803
17
1.9
17
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0
57
21
30
18
30
1.97
88356948--88357045
24
4.0
24
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10
74
23
20
16
39
1.91
88359015--88359129
44
2.6
45
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2
142
36
13
21
27
1.92
88361357--88361407
25
2.0
25
100
0
102
25
27
15
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88362847--88362913
22
3.1
22
95
2
118
58
4
0
37
1.19
88362905--88362986
9
8.9
9
70
18
53
62
6
3
28
1.36
88362884--88362993
58
1.9
55
83
5
139
60
5
2
30
1.33
88362966--88362999
7
4.7
7
96
3
59
70
0
2
26
1.01
88370357--88370419
28
2.2
29
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2
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41
0
0
58
0.98
88370332--88370426
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3.2
29
70
10
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44
0
0
55
0.99
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2.4
26
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0
106
50
8
3
38
1.48
88382319--88382375
28
2.0
28
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0
105
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1.84
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28
2.0
29
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6
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49
10
0
40
1.37
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19
2.4
19
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50
0
9
40
1.34
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35
4.5
35
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1
210
20
12
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1.88
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2.9
45
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6
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21
22
31
24
1.98
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2.5
15
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4
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32
0
8
59
1.27
88408717--88408828
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2.6
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8
133
31
25
17
25
1.97
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159
30
25
18
25
1.98
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21
2.2
20
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28
26
17
1.98
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18
2.0
17
88
5
52
74
2
0
22
0.95
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20
2.0
21
85
5
55
45
0
15
40
1.46
88422227--88422350
42
2.9
42
79
11
128
25
17
23
33
1.97
88422231--88422371
42
3.3
42
78
8
126
27
17
22
31
1.97
88441176--88441224
21
2.3
22
85
3
64
40
2
12
44
1.53
88442360--88442581
90
2.5
90
80
3
241
44
9
11
34
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88455169--88455263
27
3.4
28
88
2
120
33
28
11
26
1.91
88463238--88463306
27
2.5
27
93
6
113
31
28
13
26
1.93
88463237--88463331
27
3.4
28
85
5
104
32
29
12
25
1.93
88481839--88481885
17
2.8
17
74
3
51
8
8
4
78
1.07
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34
2.2
34
87
0
103
37
28
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28
1.79
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76
1.9
76
86
0
206
29
18
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3
13.3
3
83
0
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0
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1.9
54
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3
140
32
18
15
34
1.92
88496323--88496416
44
2.1
44
88
0
134
34
19
15
30
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325