Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  311  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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1.99
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26
24
29
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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1.14
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54
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2.0
105
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1
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44
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16
22
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
100915416--100915641
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1.94
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128
3.0
127
84
6
518
35
20
14
28
1.93
100915956--100916133
75
2.4
74
87
2
259
31
23
15
30
1.95
100915956--100916521
73
7.5
73
77
12
550
32
21
16
29
1.95
100916143--100916170
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
100916191--100916521
147
2.3
146
89
2
504
31
22
16
30
1.95
100916539--100916755
99
2.2
99
90
4
330
42
17
17
23
1.89
100916708--100916769
14
4.6
14
90
6
92
62
6
14
16
1.50
100916708--100916769
27
2.3
28
86
5
92
62
6
14
16
1.50
100916610--100916837
114
2.0
114
88
0
339
42
17
17
23
1.89
100916749--100916917
73
2.3
74
85
2
223
33
20
17
28
1.95
100922835--100922986
37
3.9
37
81
13
173
26
21
15
36
1.94
100922903--100923162
52
5.2
48
92
4
312
27
23
14
35
1.93
100922946--100923163
52
4.2
52
94
1
348
27
23
13
35
1.93
100922903--100923163
104
2.6
100
88
4
382
27
22
14
35
1.93
100928302--100928337
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
100929907--100929954
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100929903--100929954
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
100929902--100929958
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
100930079--100930165
25
3.7
24
79
10
83
55
5
6
32
1.50
100930179--100930239
25
2.5
25
81
2
70
63
0
3
32
1.10
100930178--100930309
46
2.8
46
73
15
117
60
2
3
33
1.27
100930794--100930907
30
3.8
30
88
2
176
22
2
49
25
1.63
100930794--100930907
59
1.9
60
92
1
194
22
2
49
25
1.63
100934225--100934287
29
2.2
28
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13
74
28
9
0
61
1.27
100934239--100934322
44
1.9
44
80
4
98
29
7
0
63
1.21
100935450--100935633
35
5.3
35
90
0
289
28
14
27
29
1.95
100935817--100936108
35
8.4
35
85
2
338
29
13
24
32
1.93
100935278--100935997
366
2.0
366
93
0
1235
31
17
20
30
1.96
100936698--100936751
22
2.4
22
84
3
63
14
12
12
59
1.62
100938698--100938772
11
6.9
10
73
18
53
20
16
4
60
1.52
100938688--100938770
22
3.8
22
73
12
62
20
13
4
61
1.50
100938687--100938770
33
2.5
33
78
3
98
20
13
4
61
1.49
100947182--100947244
30
2.1
30
90
0
99
58
12
3
25
1.49
100947274--100947316
22
2.0
22
90
0
68
55
6
13
23
1.62
100947709--100947766
30
1.9
31
92
3
100
17
15
13
53
1.73
100951056--100951287
40
5.8
41
85
4
303
24
21
28
25
1.99
100951056--100951307
120
2.1
120
91
2
418
23
21
28
26
1.99
100951056--100951287
80
2.9
80
88
1
340
24
21
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100952974--100953003
14
2.1
14
93
0
51
20
13
13
53
1.72
100953636--100953706
16
4.4
16
85
3
90
38
8
25
28
1.85
100953768--100953806
16
2.4
16
86
0
51
30
7
30
30
1.85
100953788--100953880
44
2.1
46
90
8
147
32
5
24
37
1.78
100953792--100953896
44
2.5
42
80
16
110
32
4
25
37
1.77
100953954--100954003
26
2.0
26
88
4
75
42
0
6
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1.26
100958491--100958540
2
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2
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0
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0
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0
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0
18
0
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2.0
43
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9
109
25
17
28
28
1.98
100975645--100975723
28
2.8
28
86
0
104
35
10
24
30
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325