Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  325  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105239451--105239507
21
2.7
21
81
8
53
33
1
3
61
1.23
105243717--105243771
25
2.2
25
96
0
101
58
21
9
10
1.60
105245720--105245795
23
3.3
23
68
17
66
28
2
11
56
1.49
105245704--105245798
47
2.0
47
97
0
181
27
4
11
56
1.53
105246856--105246883
14
2.0
14
100
0
56
57
7
7
28
1.52
105257468--105257497
5
6.0
5
96
0
51
16
40
0
43
1.48
105258428--105258473
6
8.0
6
92
4
69
0
17
10
71
1.13
105268257--105268291
15
2.3
15
85
0
52
11
34
0
54
1.37
105280662--105280688
5
5.4
5
100
0
54
59
0
0
40
0.98
105280655--105280688
15
2.3
14
90
10
50
58
0
0
41
0.98
105282474--105282540
35
1.9
35
90
0
107
32
20
13
32
1.92
105282520--105282645
35
3.6
34
86
4
171
35
22
13
28
1.92
105282484--105282656
69
2.5
70
77
0
195
34
21
13
30
1.92
105284329--105284377
26
2.0
25
88
11
75
65
4
2
28
1.22
105290876--105290972
48
2.0
48
97
0
185
32
13
13
40
1.83
105293710--105293748
19
2.1
19
100
0
78
48
10
10
30
1.70
105301781--105301808
5
5.6
5
100
0
56
60
0
0
39
0.97
105302351--105302395
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
105306948--105306992
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
105308690--105308729
18
2.1
18
86
9
53
35
5
5
55
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325

The End!