Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  321  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
33
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.5
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50
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9
11
52
1.68
103556341--103556384
23
1.9
23
90
0
70
61
6
2
29
1.34
103566216--103566274
25
2.4
25
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5
77
50
0
6
42
1.28
103570675--103570708
12
2.8
12
86
0
50
5
2
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35
1.39
103571369--103571412
16
2.8
15
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10
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2
6
34
1.38
103579965--103579992
14
2.0
14
100
0
56
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7
21
28
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20
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19
77
19
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4
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37
1.52
103588597--103588650
21
2.6
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2
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7
27
3
61
1.40
103588721--103588776
29
1.9
29
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69
3
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3
1.20
103588938--103588974
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0
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2.0
31
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0
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1.75
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0
0
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19
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2
2
70
1.10
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39
2.0
39
100
0
158
30
17
16
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
31
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0
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12
39
1.82
103623321--103623357
18
2.0
19
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5
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5
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1.48
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2.0
50
100
0
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1.89
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27
2.2
28
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11
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4
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0
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1
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1.64
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4
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0
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5
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1.99
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200
26
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24
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2.0
29
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1.9
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0
2
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2.0
20
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30
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0
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0
0
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2.4
18
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0
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20
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1.96
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1
1
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1.16
103695474--103695658
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2.0
93
98
0
361
23
16
24
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103698648--103698688
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2.3
18
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56
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2
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103699828--103699868
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2.5
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24
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1.94
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0
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0
0
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0
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103722508--103722554
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0
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2.0
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2.2
12
100
0
54
22
14
7
55
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325