Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  313  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101180844--101180941
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101180844--101180957
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2.6
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0
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23
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2.6
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0
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0
0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101195583--101195623
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18
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2.1
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11
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1.81
101214577--101214685
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3.0
38
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172
38
13
11
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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205
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1
84
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9
0
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101216866--101216925
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2.2
27
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10
0
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19
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4
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58
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2
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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11
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75
29
4
4
60
1.38
101248417--101248472
26
2.2
26
83
6
69
60
5
0
33
1.19
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21
2.2
21
96
0
85
23
4
2
70
1.16
101250184--101250252
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27
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0
0
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19
2.9
20
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15
75
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0
0
58
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101250217--101250294
38
2.1
38
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43
0
2
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1.14
101250207--101250273
28
2.4
28
83
11
77
41
0
0
58
0.98
101251669--101251716
4
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4
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51
18
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0
72
1.08
101251673--101251730
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26
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0
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1
72
1.18
101252827--101252859
17
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3
0
42
1.15
101255161--101255217
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101255161--101255239
36
2.1
38
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1.82
101255161--101255239
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19
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1.82
101255601--101255648
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2.0
24
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37
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6
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1.53
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17
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0
2
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18
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33
0
1
64
1.02
101256841--101256894
27
2.0
28
82
10
69
29
0
1
68
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
26
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0
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26
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17
2.0
17
100
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5
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5
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0
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0
38
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46
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1
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21
1.89
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1.9
184
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493
41
13
23
21
1.88
101272834--101273215
137
2.8
137
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5
457
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23
21
1.89
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4.2
26
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1
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52
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1.9
23
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5.0
7
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0
2
30
1.06
101299750--101299785
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2.5
14
86
8
54
66
0
2
30
1.06
101299803--101299875
10
7.2
10
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60
0
5
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1.20
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0
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1.20
101301772--101302540
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17.5
44
84
4
944
28
26
14
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101307687--101307730
22
2.0
23
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25
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18
1.92
101307935--101308018
28
3.0
28
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1
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3
20
1.67
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2.0
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19
4.7
19
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142
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1.83
101321610--101321696
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11
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1.83
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0
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0
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101325496--101325575
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3.5
24
69
17
80
63
3
6
26
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325