Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  75  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Score
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7
2
54
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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209
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
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Size
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Score
A
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(0-2)
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22
30
21
25
1.99
23818487--23818567
43
1.9
42
89
2
126
20
32
22
24
1.98
23825632--23826079
27
16.6
27
78
3
312
39
21
8
30
1.84
23826064--23826338
27
10.3
27
85
1
347
33
18
21
26
1.96
23826010--23826310
54
5.6
54
83
3
286
34
18
19
26
1.95
23826010--23826338
81
4.1
80
81
7
355
34
18
20
27
1.96
23826072--23826338
107
2.5
108
84
2
342
33
18
22
26
1.96
23826064--23826338
80
3.4
80
84
7
367
33
18
21
26
1.96
23826765--23826829
22
3.0
22
80
8
78
20
23
23
33
1.97
23827003--23827061
27
2.2
26
87
3
82
16
23
22
37
1.94
23827198--23827371
6
27.8
6
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20
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19
16
14
50
1.79
23827198--23827371
31
5.5
31
90
0
249
19
16
14
50
1.79
23839562--23839608
16
3.2
16
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22
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46
8
4
40
1.54
23844983--23845070
45
2.0
45
93
0
149
37
14
11
36
1.83
23848913--23849078
46
3.6
45
76
8
172
30
29
18
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23848921--23849092
93
1.8
93
88
0
263
28
28
20
22
1.99
23857524--23857690
39
4.3
39
88
3
255
29
28
22
19
1.98
23857683--23857853
39
4.4
39
91
4
265
25
24
19
29
1.99
23857514--23857808
78
3.8
78
82
6
237
27
26
21
23
1.99
23857497--23857846
117
3.0
115
80
7
316
28
27
21
23
1.99
23861661--23861818
27
5.9
27
83
11
175
34
21
25
18
1.96
23861678--23861821
54
2.7
54
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4
247
34
23
25
17
1.96
23863406--23863510
26
4.0
26
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0
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34
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8
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1.86
23866778--23867103
48
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48
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3
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24
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28
1.96
23866778--23867106
143
2.3
143
84
4
448
25
16
30
27
1.96
23866778--23867136
191
1.9
193
82
3
465
25
16
30
28
1.96
23870022--23870200
27
6.6
26
79
8
162
29
28
15
26
1.96
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83
1.9
81
88
5
235
29
28
15
26
1.96
23870045--23870200
54
2.8
56
83
2
199
30
27
15
26
1.96
23878032--23878209
27
6.6
26
80
7
169
29
28
15
26
1.96
23878053--23878208
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
23882202--23882238
18
2.1
18
100
0
74
32
40
16
10
1.83
23897953--23898343
47
8.3
47
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1
588
32
10
30
26
1.90
23898194--23898315
22
5.3
22
62
21
61
33
11
29
25
1.91
23897954--23898322
94
3.9
94
96
0
659
32
11
30
26
1.91
23900576--23900893
48
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48
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1
379
25
17
29
27
1.97
23900620--23900893
144
1.9
144
89
0
422
24
17
30
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23900576--23900947
96
3.9
96
82
2
282
26
17
28
27
1.98
23912340--23912578
50
4.8
49
80
6
257
30
25
17
26
1.97
23912340--23912578
101
2.4
99
85
4
302
30
25
17
26
1.97
23928275--23928324
18
2.8
18
84
0
64
52
12
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20
1.75
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30
21
25
23
1.99
23936810--23936989
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1.8
97
82
8
231
30
21
25
23
1.99
23944503--23944623
49
2.5
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4
147
30
17
27
24
1.97
23944643--23944821
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22
27
22
1.99
23947250--23947421
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1.8
94
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3
267
20
19
30
29
1.97
23947254--23947429
47
3.8
46
75
15
173
21
19
30
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325